Summary

Le test basé sur la microscopie pour étudier et analyser les endosomes de recyclage à l’aide du trafic SNARE

Published: February 12, 2022
doi:

Summary

Les endosomes de recyclage font partie du réseau tubulaire endosomal. Nous présentons ici une méthode pour quantifier la dynamique du recyclage des endosomes en utilisant GFP-STX13 comme marqueur d’organite.

Abstract

Les endosomes de recyclage (RE) sont des organites tubulaires-vésiculaires générés à partir d’endosomes précoces/triés dans tous les types de cellules. Ces organites jouent un rôle clé dans la biogenèse des mélanosomes, un organite lié aux lysosomes produit par les mélanocytes. Les ER délivrent la cargaison spécifique aux mélanocytes aux mélanosomes prématurés pendant leur formation. Le blocage dans la génération d’EI, observé chez plusieurs mutants du syndrome de Hermansky-Pudlak, entraîne une hypopigmentation de la peau, des cheveux et des yeux. Par conséquent, l’étude de la dynamique (se référer au nombre et à la longueur) des ER est utile pour comprendre la fonction de ces organites dans des conditions normales et pathologiques. Dans cette étude, nous visons à mesurer la dynamique des ER à l’aide d’un SNARE STX13 résident.

Introduction

La biosynthèse des pigments de mélanine se produit dans les mélanosomes, un organite spécifique des lysosomes (LRO) spécifique aux mélanocytes qui coexiste avec les lysosomes conventionnels. Le système endocytaire joue un rôle clé dans la biogenèse des mélanosomes, nécessaires à la couleur de la peau et à la photoprotection contre les rayonnements ionisants1,2,3. Au cours de ce processus, les enzymes de synthèse de la mélanine sont triées sur des endosomes précoces / triés, puis transportées vers des mélanosomes prématurés par le biais d’endosomes tubulaires ou vésiculaires appelés endosomes de recyclage (URE)4,5,6,7,8,9,10. Le ciblage et la fusion de ces organites régulent la maturation des mélanosomes pigmentés entièrement fonctionnels7,11,12,13,14. Des défauts dans la formation de ces organites ou le tri de la cargaison vers ces organites provoquent un albinisme oculo-cutané et d’autres phénotypes cliniques, observés dans le syndrome de Hermansky-Pudlak15,16.

Nous décrivons ici une technique simple basée sur la microscopie pour étudier et analyser les ER. Dans cette méthode, nous avons tiré parti d’une protéine transmembranaire, Qa-SNARE Syntaxin (STX)13 qui réside sur le recyclage des endosomes17 et les cycles entre le tri des endosomes et des mélanosomes dans les mélanocytes12,18. De plus, la suppression du domaine réglementaire non structuré N-terminal (à savoir SynN ou STX13Δ129) permet au SNARE de rester coincé dans les mélanosomes, ce qui mesure la voie de trafic vers le mélanosome12. Nous avons utilisé un marqueur endosomamal de recyclage connu Rab GTPase (Rab)11 dans nos études14,19. L’imagerie par fluorescence des protéines GFP-STX13WT, GFP-STX13Δ129, mCherry-Rab11 et TYRP1 dans les mélanocytes de type sauvage, suivie de la quantification de leur localisation relative, fournira la nature et la dynamique des ERE en plus de leur ciblage sur les mélanosomes. Il s’agit donc d’une technique simple qui peut être utilisée pour visualiser et mesurer la dynamique des ER dans les mélanocytes.

Protocol

Le protocole implique l’ensemencement des mélanocytes suivi d’une transfection des plasmides. D’autres étapes comprennent la fixation, l’immunocoloration, l’imagerie et l’analyse des cellules pour mesurer la longueur et le nombre d’EI. La description détaillée du protocole est donnée ci-dessous. 1. Ensemencement de mélanocytes de souris sur des couvertures prétraitées Enduire les couvercles de verre dans une boîte de Petri (c’est-à-dire 4 à…

Representative Results

Quantification de la localisation du mutant STX13Δ129 dans les mélanosomesLa microscopie par immunofluorescence de STX13 dans des mélanocytes de type sauvage de souris a montré que GFP-STX13WT était localisé sous forme de structures vésiculeuses et tubulaires et que GFP-STX13Δ129 était localisé sous forme de structures en forme d’anneau en plus de la surface cellulaire (Figure 1A). De plus, le…

Discussion

Les endosomes de recyclage sont une cohorte d’organites endocytaires, et ils interviennent dans le recyclage de la cargaison à la surface cellulaire dans tous les types de cellules21,22,23,24,25. Dans les types cellulaires spécialisés tels que les mélanocytes, ces organites détournent en partie leur voie de trafic vers les mélanosomes pour leur biogen?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ce travail a été soutenu par le Département de biotechnologie (BT/PR32489/BRB/10/1786/2019 à la SSRS); Conseil de la recherche en sciences et en génie (CRG/2019/000281 à la SSRS); DBT-NBACD (BT/HRD-NBA-NWB/38/2019-20 à la SSR) et programme de partenariat IISc-DBT (à la SSR). L’infrastructure du ministère était soutenue par DST-FIST, DBT et UGC. AMB était soutenu par DBT-JRF (DBT/2015/IISc/NJ-02).

Materials

anti-TYRP1 antibody (TA99) ATCC HB-8704
Fluoromount-G Southern Biotech 0100-01
Lipofectamine 2000 ThermoFisher Scientific 11668-500
Matrigel matrix BD Biosciences 356231
OPTI-MEM ThermoFisher Scientific 022600-050
Phorbol-12-myristate-13-acetate Sigma-Aldrich P8139
RPMI Medium 1640 ThermoFisher Scientific 31800-022

References

  1. Dell’Angelica, E. C. The building BLOC(k)s of lysosomes and related organelles. Current Opinion in Cell Biology. 16 (4), 458-464 (2004).
  2. Raposo, G., Marks, M. S. Melanosomes–dark organelles enlighten endosomal membrane transport. Nature Reviews in Molecular Cell Biology. 8 (10), 786-797 (2007).
  3. Ohbayashi, N., Fukuda, M. Recent advances in understanding the molecular basis of melanogenesis in melanocytes. F1000Research. 9, (2020).
  4. Theos, A. C., et al. Functions of adaptor protein (AP)-3 and AP-1 in tyrosinase sorting from endosomes to melanosomes. Molecular Biology of the Cell. 16 (11), 5356-5372 (2005).
  5. Di Pietro, S. M., et al. BLOC-1 interacts with BLOC-2 and the AP-3 complex to facilitate protein trafficking on endosomes. Molecular Biology of the Cell. 17 (9), 4027-4038 (2006).
  6. Setty, S. R., et al. BLOC-1 is required for cargo-specific sorting from vacuolar early endosomes toward lysosome-related organelles. Molecular Biology of the Cell. 18 (3), 768-780 (2007).
  7. Delevoye, C., et al. AP-1 and KIF13A coordinate endosomal sorting and positioning during melanosome biogenesis. Journal of Cell Biology. 187 (2), 247-264 (2009).
  8. Bultema, J. J., Ambrosio, A. L., Burek, C. L., Di Pietro, S. M. BLOC-2, AP-3, and AP-1 proteins function in concert with Rab38 and Rab32 proteins to mediate protein trafficking to lysosome-related organelles. Journal of Biological Chemistry. 287 (23), 19550-19563 (2012).
  9. Sitaram, A., et al. Differential recognition of a dileucine-based sorting signal by AP-1 and AP-3 reveals a requirement for both BLOC-1 and AP-3 in delivery of OCA2 to melanosomes. Molecular Biology of the Cell. 23 (16), 3178-3192 (2012).
  10. Nag, S., et al. Rab4A organizes endosomal domains for sorting cargo to lysosome-related organelles. Journal of Cell Science. 131 (18), (2018).
  11. Dennis, M. K., et al. BLOC-2 targets recycling endosomal tubules to melanosomes for cargo delivery. Journal of Cell Biology. 209 (4), 563-577 (2015).
  12. Jani, R. A., Purushothaman, L. K., Rani, S., Bergam, P., Setty, S. R. STX13 regulates cargo delivery from recycling endosomes during melanosome biogenesis. Journal Cell Science. 128 (17), 3263-3276 (2015).
  13. Shakya, S., et al. Rab22A recruits BLOC-1 and BLOC-2 to promote the biogenesis of recycling endosomes. EMBO Reports. 19 (12), 45918 (2018).
  14. Bowman, S. L., et al. A BLOC-1-AP-3 super-complex sorts a cis-SNARE complex into endosome-derived tubular transport carriers. Journal of Cell Biology. 220 (7), 202005173 (2021).
  15. Wei, M. L. Hermansky-Pudlak syndrome: a disease of protein trafficking and organelle function. Pigment Cell Research. 19 (1), 19-42 (2006).
  16. Bowman, S. L., Bi-Karchin, J., Le, L., Marks, M. S. The road to lysosome-related organelles: Insights from Hermansky-Pudlak syndrome and other rare diseases. Traffic. 20 (6), 404-435 (2019).
  17. Prekeris, R., Klumperman, J., Chen, Y. A., Scheller, R. H. Syntaxin 13 mediates cycling of plasma membrane proteins via tubulovesicular recycling endosomes. Journal of Cell Biology. 143 (4), 957-971 (1998).
  18. Mahanty, S., et al. Rab9A is required for delivery of cargo from recycling endosomes to melanosomes. Pigment Cell Melanoma Research. 29 (1), 43-59 (2016).
  19. Delevoye, C., et al. Recycling endosome tubule morphogenesis from sorting endosomes requires the kinesin motor KIF13A. Cell Reports. 6 (3), 445-454 (2014).
  20. Ha, L., et al. ARF functions as a melanoma tumor suppressor by inducing p53-independent senescence. Proceedings of the National Academy of Science U. S. A. 104 (26), 10968-10973 (2007).
  21. Soldati, T., Schliwa, M. Powering membrane traffic in endocytosis and recycling. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 7 (12), 897-908 (2006).
  22. Grant, B. D., Donaldson, J. G. Pathways and mechanisms of endocytic recycling. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 10 (9), 597-608 (2009).
  23. Hsu, V. W., Prekeris, R. Transport at the recycling endosome. Current Opinion in Cell Biology. 22 (4), 528-534 (2010).
  24. Taguchi, T. Emerging roles of recycling endosomes. Journal of Biochemistry. 153 (6), 505-510 (2013).
  25. Goldenring, J. R. Recycling endosomes. Current Opinion in Cell Biology. 35, 117-122 (2015).
  26. Delevoye, C., Marks, M. S., Raposo, G. Lysosome-related organelles as functional adaptations of the endolysosomal system. Current Opinion in Cell Biology. 59, 147-158 (2019).
  27. Hsu, V. W., Bai, M., Li, J. Getting active: protein sorting in endocytic recycling. Nature Reviews in Molecular Cell Biology. 13 (5), 323-328 (2012).
  28. Desfougeres, Y., D’Agostino, M., Mayer, A. A modular tethering complex for endosomal recycling. Nature Cell Biology. 17 (5), 540-541 (2015).
  29. Le, L., Sires-Campos, J., Raposo, G., Delevoye, C., Marks, M. S. Melanosome biogenesis in the pigmentation of mammalian skin. Integrated Computational Biology. 61 (4), 1517-1545 (2021).

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Cite This Article
Bhatt, A. M., Setty, S. R. G. The Microscopy-Based Assay to Study and Analyze the Recycling Endosomes using SNARE Trafficking. J. Vis. Exp. (180), e63087, doi:10.3791/63087 (2022).

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