本文提供了一个分步指南,以研究蛋白质亚细胞定位动力学,并使用高分辨率荧光显微镜监测葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的形态变化。
对影响细菌细胞分裂和细胞形状的因素的调查通常与高分辨率荧光显微镜一起进行,因为在总体水平上进行的观察可能无法真正反映单个细胞水平上发生的情况。活细胞延时显微镜使研究人员能够监测细胞分裂或细胞形态的变化,从而提供有关蛋白质亚细胞定位和基因表达时间的宝贵见解,从而有可能有助于回答重要的生物学问题。在这里,我们描述了使用高分辨率去卷积显微镜监测亚基利杆菌和金黄色葡萄球菌的形态变化的协议。本报告的目的是提供一个简单明了的协议,可以由有兴趣进行荧光显微镜实验的其他研究人员采用,以研究细菌和其他生物体的不同生物过程。
最近显微镜技术1,2的进步,大大加强了细菌细胞生物学领域。在其他仪器中,能够进行延时荧光显微镜实验的显微镜仍然是一种宝贵的工具。研究者可以使用荧光蛋白实时监测各种生理事件,如绿色荧光蛋白(GFP)基转录和翻译报告器融合、荧光D-氨基酸(FDAA)3,或者使用其他污渍标记细胞壁、膜和DNA。因此,荧光显微镜在微生物细胞生物学家中仍然很受欢迎也就不足为奇了。除了简单地显示末端表型,提供有关观察到的表型如何产生的信息使用延时显微镜可以增加重大价值的发现,并可能提供线索,什么细胞过程是潜在的药物候选者的目标4。
本文提供了使用全电动、倒置广域荧光显微镜进行高分辨率成像的协议(参见材料表)。这些方案可以适应其他荧光显微镜的需求,这些显微镜能够进行延时显微镜检查。虽然这里讨论的软件对应于材料表中所示的特定制造商提供的软件,但其他显微镜制造商通常提供的软件或免费提供的 ImageJ5具有用于分析显微镜数据的等效工具。对于时间推移不利于的条件,可以进行时间过程实验,如本文所述。此处描述的协议为研究两种不同细菌物种的树型变化提供了详细的指南:B. subtilis和S. aureus。有关使用的菌株,请参阅表 1。
显微镜一直是有关微生物的研究的支柱。鉴于其微米级细胞大小,单细胞水平研究传统上依赖于电子显微镜(EM)。虽然EM近年来已经成为一种非常强大的技术,但它除了有限的用户访问16之外,还有它自己的内在限制。荧光显微镜技术的改进和不同荧光探针(如FDAA3)的开发为微生物细胞生物学家提供了大量工具,用于研究活细胞中的各种细胞过程。研究人员?…
The authors have nothing to disclose.
我们感谢我们的实验室成员对本文的评论。这项工作由南佛罗里达大学(PE)的启动赠款资助。
Agarose | Fisher BioReagents | BP160-100 | Molecular Biology Grade – Low EEO |
DAPI | Invitrogen | D3571 | Microscopy |
FM4-64 | Invitrogen | T3166 | Microscopy |
Glass bottom dish | MatTek | P35G-1.5-14-C | Microscopy |
IPTG | Fisher BioReagents | BP1755-10 | Dioxane-free |
Microscope | GE | DeltaVision Elite | Customized Olympus IX-71 Inverted Microscope Stand; Custom Illumination Tower and Transmitted Light Illuminator Module. Objectives: PLAPON 60X (N.A. 1.42, WD 0.15 mm); OLY 100X OIL (N.A. 1.4, WD 0.12 mm); DIC Prism Nomarski for 100X Objective; CoolSnap HQ2 camera; SSI Assembly 7-color; Environmental control chamber – opaque. |
PC190723 | MilliporeSigma | 3445805MG | FtsZ inhibitor |
SoftWorx | GE | Manufacturer-supplied imaging software |