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RNA 시퀀싱을 위한 3개의 차동 발현 분석 방법: 림마, EdgeR, DESeq2
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Cancer Research
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JoVE Journal
Cancer Research
Three Differential Expression Analysis Methods for RNA Sequencing: limma, EdgeR, DESeq2
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
RNA 시퀀싱을 위한 3개의 차동 발현 분석 방법: 림마, EdgeR, DESeq2
DOI:
10.3791/62528-v
•
10:10 min
•
September 18, 2021
•
Shiyi Liu*
1
,
Zitao Wang*
1
,
Ronghui Zhu
,
Feiyan Wang
,
Yanxiang Cheng
,
Yeqiang Liu
1
Department of Obstetrics and Gynecology
,
Renmin Hospital of Wuhan University
,
2
Department of Pathology, Shanghai Skin Disease Hospital
,
Tongji University School of Medicine
Chapters
00:08
Introduction
01:54
I. Download and preprocess the data
05:12
II. RNA‐seq differential expression analysis through “limma”
08:53
III. RNA‐seq differential expression analysis through
“edgeR”
11:34
IV. RNA‐seq differential expression analysis through “DESeq2”
13:51
V. Venn diagram
14:36
Conclusion
Summary
Automatic Translation
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português (Portuguese)
русский (Russian)
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Türkçe (Turkish)
Automatic Translation
RNA 시퀀싱을 위한 차동 발현 분석 방법의 상세한 프로토콜이 제공되었다: 림마, EdgeR, DESeq2.
Tags
RNA Sequencing
Differential Expression Analysis
Limma
EdgeR
DESeq2
Cholangiocarcinoma
Cancer
Gene Expression
Ensemble Gene ID
Gene Symbol
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