JoVE
JoVE
Faculty Resource Center
Research
Behavior
Biochemistry
Biology
Bioengineering
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
JoVE Chrome Extension
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Authors
Librarians
High Schools
About
Sign-In
Sign In
Contact Us
Research
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
High Schools
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Research
Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
Products
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
Products
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to Your Course
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Journal
/
Cancer Research
/
ثلاث طرق لتحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبي: ليما، إيدج آر، DESeq2
JoVE Journal
Cancer Research
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.
Sign in or start your free trial.
JoVE Journal
Cancer Research
Three Differential Expression Analysis Methods for RNA Sequencing: limma, EdgeR, DESeq2
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
ثلاث طرق لتحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبي: ليما، إيدج آر، DESeq2
DOI:
10.3791/62528-v
•
10:10 min
•
September 18, 2021
•
Shiyi Liu*
1
,
Zitao Wang*
1
,
Ronghui Zhu
,
Feiyan Wang
,
Yanxiang Cheng
,
Yeqiang Liu
1
Department of Obstetrics and Gynecology
,
Renmin Hospital of Wuhan University
,
2
Department of Pathology, Shanghai Skin Disease Hospital
,
Tongji University School of Medicine
Chapters
00:08
Introduction
01:54
I. Download and preprocess the data
05:12
II. RNA‐seq differential expression analysis through “limma”
08:53
III. RNA‐seq differential expression analysis through
“edgeR”
11:34
IV. RNA‐seq differential expression analysis through “DESeq2”
13:51
V. Venn diagram
14:36
Conclusion
Summary
Automatic Translation
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Automatic Translation
وقدم بروتوكول مفصل لأساليب تحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبي: ليما، إيدج آر، DESeq2.
Tags
RNA Sequencing
Differential Expression Analysis
Limma
EdgeR
DESeq2
Cholangiocarcinoma
Cancer
Gene Expression
Ensemble Gene ID
Gene Symbol
Low-expressed Genes
Design Matrix
DGEList
Normalization
Linear Model
T-statistic
F-statistic
Log-odds
Log2 Fold Change
FDR
Article
Embed
ADD TO PLAYLIST
Usage Statistics
Related Videos
باستخدام الحمض النووي الريبي لكشف التسلسل رواية لصق المتغيرات ذات الصلة لمقاومة المخدرات في<em> في المختبر</em> نماذج السرطان
هلام ثنائي الأبعاد التفريد مقترنة بأساليب الطيف الكتلي لتحليل البروتين الأنسجة البشرية الورم الحميد الغدة النخامية
نموذج المصفوفة خارج الخلية العظام ثلاثية الأبعاد ل Osteosarcoma
التسلسل الصغيرة غير الترميز RNA من Formalin-الانسجه الثابتة ومصل المشتقات Exosomes من المرضي سرطان البروستاتا المقاوم
تقييم موت الخلية باستخدام الخلايا الخالية من البروبيوتيك في الثقافات الكروية ثلاثية الأبعاد للخلايا السرطانية القولون والمستقيم
الآلي التفاضلية النووية التفضيل الملطخة اختبار لتحديد دقيق للسمية الخلوية الميتوك
بروتوكول التشريح الآلي لإثراء الورم في الأنسجة منخفضة محتوى الورم
التنميط المكاني للبروتين وتعبير الحمض النووي الريبي في الأنسجة: نهج لضبط التشريح المجهري الافتراضي
وسيط الفوسفوليبيد الناجم عن التحول في الثقافات ثلاثية الأبعاد
جيل سايبريد ناقل الغضروف باستخدام خطوط الخلايا السرطانية
Read Article