ここでは、自由に利用可能なツールを使用して16S rRNAメタゲノムシーケンシングおよび分析を使用したマイクロバイオームプロファイリングの簡略化された標準的な操作手順を説明します。このプロトコルは、マイクロバイオーム分野に新しい研究者だけでなく、より高い解像度で細菌プロファイリングを達成するための方法の更新を必要とする研究者を支援します。