Journal
/
Biology
/
Microbiota-analyse met behulp van twee-stap PCR en de volgende generatie 16S rRNA Gensequencing
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Microbiota-analyse met behulp van twee-stap PCR en de volgende generatie 16S rRNA Gensequencing

DOI:
10.3791/59980-v

•

11:22 min

•

October 15, 2019

•

, , ,
1Department of Pathology,University of Iowa, 2Medical Scientist Training Program,University of Iowa, 3Graduate Program in Immunology,University of Iowa, 4Graduate Program in Molecular Medicine,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Hier beschreven is een vereenvoudigde standaard werkings procedure voor microbiome profilering met behulp van 16S rRNA metagenomic sequencing en analyse met behulp van vrij beschikbare instrumenten. Dit protocol zal onderzoekers die nieuw zijn in het microbiome veld en degenen die updates vereisen over methoden om bacteriële profilering bij een hogere resolutie te bereiken helpen.

Tags

MicrobiomeMicrobiota16S RRNA Gene SequencingNext-generation SequencingFecal SampleDNA ExtractionPCRGut MicrobiomeMicrobial Profiling

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Fluorescentie-microscopie Screening en next-generation sequencing: Handige hulpmiddelen voor de identificatie van genen betrokken bij organel Integriteit

Next-generation sequencing van het 16S ribosomaal RNA Gene Amplicons

Gerichte DNA methylatie analyse van next-generation sequencing

Versterking, next-generation sequencing en Genomic DNA in kaart brengen van retrovirale integratie Sites

Efficiënte Nucleic Acid Extraction en 16S rRNA Gene Sequencing voor Bacteriële Gemeenschap karakterisering

Begeleide Protocol voor fecale microbiële karakterisering door 16S rRNA-Amplicon Sequencing

Interactome-Seq: Een Protocol voor Domainome bibliotheek bouw, de validatie en de selectie door Phage Display en volgende generatie sequentiebepaling

Karakterisering van het Microbiome van de teek door Next-Generation 16S rRNA Amplicon sequentiebepaling

Tweestaps omgekeerde transcriptiedruppel digitale PCR-protocollen voor SARS-CoV-2-detectie en kwantificering

Een op magnetische kraal gebaseerd mosquito-DNA-extractieprotocol voor sequencing van de volgende generatie

Read Article