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Analisi microbiota utilizzando PCR in due fasi e sequenziamento genico rRNA 16S di nuova generazione
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Biology
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JoVE Journal Biology
Microbiota Analysis Using Two-step PCR and Next-generation 16S rRNA Gene Sequencing
DOI:

11:22 min

October 15, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:25Extraction of DNA from Fecal Sample
  • 02:2916S rRNA Gene Amplification (PCR1) and DNA Library Construction (PCR2)
  • 03:57Clean-up of Indexed PCR (PCR2) and Quantification
  • 06:03Sequence Analysis
  • 07:49Results: Quality Profile and Statistical Analysis
  • 09:29Conclusion

Summary

Automatic Translation

Di seguito è descritta una procedura operativa standard semplificata per la profilazione del microbioma che utilizza il sequenziamento e l'analisi metagenomica del rRNA 16S utilizzando strumenti liberamente disponibili. Questo protocollo aiuterà i ricercatori che non hanno familiarità con il campo del microbioma e quelli che richiedono aggiornamenti sui metodi per ottenere una profilazione batterica a una risoluzione più elevata.

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