Summary

Белки неправильного сворачивания Циклические Усиление Прионы

Published: November 07, 2012
doi:

Summary

Белки неправильного сворачивания циклической амплификации (PMCA) является в пробирке анализа для изучения преобразования прионных и деформаций и виды барьеров. Она также может быть использована в качестве теста обнаружения прионов.

Abstract

Прионы инфекционных агентов, которые вызывают неизбежно смертельный передающийся губчатой ​​энцефалопатии (TSE) у животных и человека 9,18. Прионных белков имеет два различных изоформ, неинфекционные хост-кодируемого белка (PrP C) и инфекционные белки (PrP Sc), неправильно сложенные изоформы PrP C 8.

Одна из проблем работы с прионных агентов длительный инкубационный период до развития клинических симптомов после прививки хозяин 13. Это традиционно поручил длительного и дорогостоящего исследования на животных биопроб. Кроме того, биохимических и биофизических свойств PrPSc, плохо характеризуется из-за их необычного экстерьера и агрегации государства.

PrPSc, может семена превращение PrP C в PrPSc, в пробирке 14. PMCA находится в технике пробирке, которая принимает ADVAntage этой возможностью использования ультразвука и инкубации циклов, чтобы производить большое количество PrPSc, в ускоренном темпе, с системой, содержащей избыточное количество PrP C и незначительное количество семян PrPSc, 19. Этот метод оказался эффективным повторять вида и штамма специфику PrPSc, преобразование из PrP C, подражать вмешательства прионных деформации, а для усиления очень низким уровнем PrPSc, из инфицированных тканей, жидкостей и проб окружающей среды, 6,7,16, 23.

Эта статья подробно протокол PMCA, включая рекомендации по минимизации загрязнения, создавая устойчивые результаты, и количественной оценки этих результатов. Мы также обсудим несколько приложений PMCA, в том числе производства и характеристика инфекционного штамма приона, интерференция прионных деформации и обнаружения прионов в окружающей среде.

Protocol

1. Подготовка оборудования Используйте Misonix 3000 или 4000 Misonix ультразвукового (Farmingdale, Нью-Йорк), подключенных к Thermo Electron Neslab EX-7 водяной бане (Newington, Нью-Гэмпшир), чтобы сохранить постоянную температуру 37 ° C. Разрушать ультразвуком образца в 200 мкл тонкостенных труб ПЦР полосы с куполооб?…

Representative Results

Белки неправильного сворачивания циклической амплификации (PMCA) используется для усиления PrPSc, в пробирке 7, 12, 14, 19, 24. Успешное PrPSc, усиление показали увеличение интенсивности полосы на Западной блоттинга PK-устойчивых прионных белков (миграция между 19 и 30 кДа для хо…

Discussion

Проблемы усиливающей инфекционных белков прионных являются длительные периоды инкубации и расходов в естественных условиях эксперименты. Техника PMCA является экономически эффективным средством для усиления инфекционных агентов прионов. Несколько лабораторий подтвердили спос?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Мы хотели бы поблагодарить д-ра Венеры Fe Мария Рамос за критическое прочтение рукописи. Эта работа была поддержана Национальным центром ресурсов исследований (P20 RR0115635-6, C06 RR17417-01 и G20RR024001) и Национального института неврологических расстройств и инсульта (2R01 NS052609).

Materials

Reagent / Equipment Manufacturer Cat. Number
Misonix 3000 Misonix S-3000
Misonix 4000 Misonix S-4000
Tenbroeck Tissue Grinder Kontes 885000-0007
Neslab EX-7 Water Bath Thermo Electron Neslab EX-7
0.2 ml PCR Tube Strips Thermo Scientific AB-0451
Triton X-100 Sigma Aldrich T9284-100ML
Complete Protease Inhibitor Roche 11 697 498 001
EDTA J.T. Baker 4040-00
DPBS Mallinckrodt Baker Mediatech 21-031-CV
Versi-Dry Lab Soakers Fisher Scientific 14 206 28
Repti Therm Heater Zoo Med Laboratories, Inc. RH-4

References

  1. Ayers, J. I., Schutt, C. R., Shikiya, R. A., Aguzzi, A., Kincaid, A. E., Bartz, J. C. The strain-encoded relationship between PrP replication, stability and processing in neurons is predictive of the incubation period of disease. PLoS pathogens. 7, e1001317 (2011).
  2. Barria, M. A., Mukherjee, A., Gonzalez-Romero, D., Morales, R., Soto, C. De novo generation of infectious prions in vitro produces a new disease phenotype. PLoS Pathog. 5, e1000421 (2009).
  3. Bessen, R. A., Marsh, R. F. Biochemical and physical properties of the prion protein from two strains of the transmissible mink encephalopathy agent. J. Virol. 66, 2096-2101 (1992).
  4. Bessen, R. A., Marsh, R. F. Distinct PrP properties suggest the molecular basis of strain variation in transmissible mink encephalopathy. J. Virol. 68, 7859-7868 (1994).
  5. Bessen, R. A., Marsh, R. F. Identification of two biologically distinct strains of transmissible mink encephalopathy in hamsters. J. Gen. Virol. 73, 329-334 (1992).
  6. Castilla, J., Gonzalez-Romero, D., Saa, P., Morales, R., De Castro, J., Soto, C. Crossing the species barrier by PrP(Sc) replication in vitro generates unique infectious prions. Cell. 134, 757-768 (2008).
  7. Castilla, J., Morales, R., Saa, P., Barria, M., Gambetti, P., Soto, C. Cell-free propagation of prion strains. EMBO J. 27, 2557-2566 (2008).
  8. Caughey, B., Raymond, G. J. The scrapie-associated form of PrP is made from a cell surface precursor that is both protease- and phospholipase-sensitive. J. Biol. Chem. 266, 18217-18223 (1991).
  9. Deleault, N. R., Harris, B. T., Rees, J. R., Supattapone, S. Formation of native prions from minimal components in vitro. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 9741-9746 (2007).
  10. Dickinson, A. G., Fraser, H., Meikle, V. M., Outram, G. W. Competition between different scrapie agents in mice. Nat. New Biol. 237, 244-245 (1972).
  11. Gonzalez-Romero, D., Barria, M. A., Leon, P., Morales, R., Soto, C. Detection of infectious prions in urine. FEBS Lett. 582, 3161-3166 (2008).
  12. Green, K. M., Castilla, J., Seward, T. S., Napier, D. L., Jewell, J. E., Soto, C., Telling, G. C. Accelerated high fidelity prion amplification within and across prion species barriers. PLoS Pathog. 4, e1000139 (2008).
  13. Hadlow, W. J., Race, R. E., Kennedy, R. C. Temporal distribution of transmissible mink encephalopathy virus in mink inoculated subcutaneously. J. Virol. 61, 3235-3240 (1987).
  14. Kocisko, D. A., Come, J. H., Priola, S. A., Chesebro, B., Raymond, G. J., Lansbury, P. T., Caughey, B. Cell-free formation of protease-resistant prion protein. Nature. 370, 471-474 (1994).
  15. Kurt, T. D., Telling, G. C., Zabel, M. D., Hoover, E. A. Trans-species amplification of PrP(CWD) and correlation with rigid loop 170N. Virology. 387, 3235-3240 (2009).
  16. Maddison, B. C., Baker, C. A., Terry, L. A., Bellworthy, S. J., Thorne, L., Rees, H. C., Gough, K. C. Environmental sources of scrapie prions. J. Virol. 84, 11560-11562 (2010).
  17. Nichols, T. A., Pulford, B., Wyckoff, A. C., Meyerett, C., Michel, B., Gertig, K., Hoover, E. A., Jewell, J. E., Telling, G. C., Zabel, M. D. Detection of protease-resistant cervid prion protein in water from a CWD-endemic area. Prion. 3, 171-183 (2009).
  18. Prusiner, S. B. Novel proteinaceous infectious particles cause scrapie. Science. 216, 136-144 (1982).
  19. Saborio, G. P., Permanne, B., Soto, C. Sensitive detection of pathological prion protein by cyclic amplification of protein misfolding. Nature. 411, 810-813 (2001).
  20. Saunders, S. E., Bartz, J. C., Vercauteren, K. C., Bartelt-Hunt, S. L. An enzymatic treatment of soil-bound prions effectively inhibits replication. Appl. Environ. Microbiol. 77, 4313-4317 (2011).
  21. Saunders, S. E., Shikiya, R. A., Langenfeld, K., Bartelt-Hunt, S. L., Bartz, J. C. Replication efficiency of soil-bound prions varies with soil type. Journal of virology. , (2011).
  22. Schutt, C. R., Bartz, J. C. Prion interference with multiple prion isolates. Prion. 2, 61-63 (2008).
  23. Shikiya, R. A., Ayers, J. I., Schutt, C. R., Kincaid, A. E., Bartz, J. C. Co-infecting prion strains compete for a limiting cellular resource. Journal of. 84, 5706-5714 (2010).
  24. Shikiya, R. A., Bartz, J. C. In vitro generation of high titer prions. Journal of virology. , (2011).
  25. Weber, P., Giese, A., Piening, N., Mitteregger, G., Thomzig, A., Beekes, M., Kretzschmar, H. A. Generation of genuine prion infectivity by serial PMCA. Veterinary microbiology. 123, 346-357 (2007).

Play Video

Cite This Article
Saunders, S. E., Bartz, J. C., Shikiya, R. A. Protein Misfolding Cyclic Amplification of Prions. J. Vis. Exp. (69), e4075, doi:10.3791/4075 (2012).

View Video