Summary

食道腺癌オルガノイドの継代培養と凍結保存:単一細胞消化の長所と短所

Published: July 06, 2022
doi:

Summary

このプロトコルは、単一細胞消化の有無にかかわらず食道腺癌オルガノイドの継代培養および凍結保存の方法を記述し、研究者が実験計画に基づいて適切な戦略を選択できるようにする。

Abstract

腫瘍形成および治療戦略を探求するための原疾患を反映する適切なトランスレーショナルリサーチモデルの欠如は、食道腺癌(EAC)における大きな障害である。患者由来のオルガノイド(PDO)は、最近、様々な癌における顕著な前臨床モデルとして浮上している。ただし、EAC PDO の開発に使用できるプロトコルはまだ限られています。PDO が確立されると、伝播と凍結保存は、さらに下流の解析に不可欠です。ここでは、EAC PDOの継代培養および凍結保存のために、すなわち、単一細胞消化の有無にかかわらず、2つの異なる方法が標準化されている。どちらの方法も、適切な細胞生存率を確実に得ることができ、多様な実験セットアップに適用可能である。現在の研究は、単一細胞消化によるEAC PDOの継代培養が、細胞数制御、均一な密度、およびサイズ追跡を容易にする中空構造を必要とするほとんどの実験に適していることを実証した。しかしながら、単一細胞ベースの方法は、培養中および凍結ストックからの再培養後に遅い成長を示す。また、単一細胞消化による継代培養は、中空コアで中空構造を形成することを特徴とする。対照的に、単一細胞消化なしでEAC PDOを処理することは、凍結保存、拡張、および組織学的特徴付けに有利である。このプロトコルでは、単一細胞消化の有無にかかわらずEAC PDOの継代培養および凍結保存の長所と短所が説明されており、研究者はオルガノイドを処理および調査するための適切な方法を選択できます。

Introduction

食道がん(EC)は、世界のがんによる死亡原因の第10位および第6位の死因1位です。食道腺癌(EAC)は、ECの主要な組織学的サブタイプの1つであり、主に西洋諸国で発生する2。ここ10年間で、EACの発生率はドイツを含む多くの先進国で大幅に増加しています3。がんの攻撃性および腫瘍発生の初期段階における症状の欠如のために、EAC患者の全体的な予後は悪く、約20%の5年生存率を示す245

20世紀後半以来、EACの生物医学研究のためにいくつかのモデルが確立されてきました。1990年代に確立された古典的なヒトEAC細胞株6は、EAC腫瘍生物学、腫瘍遺伝学、抗腫瘍戦略に関する知識を拡張し、EAC研究で一般的に使用されています。その上、いくつかの研究グループは、外科的または炎症的アプローチを介して胃食道逆流などの既知の危険因子に動物を曝露することによって、EACまたはバレット食道の動物モデルの開発に成功している7,8,9加えて、EAC原発性癌組織を皮下または同所性に免疫不全マウスに生着させる患者由来異種移植片(PDX)モデルが、ヒトEAC腫瘍の生物学的挙動および腫瘍環境をシミュレートするために開発された101112。しかし、これらのモデルが臨床応用を改善し、EACの腫瘍形成と進行の背後にある分子メカニズムの理解を向上させているにもかかわらず、これらの研究モデルからヒトに結果を推定することは依然として大きな課題があります。

患者由来の腫瘍オルガノイド(PDO)は、インビトロでヒトの発達および臓器再生を模倣する3D培養系で増殖される。患者の原発組織から生成されるPDOは、ヒト腫瘍の分子的および表現型的特徴を再現し、医薬品開発および個別化がん治療における有望な用途を示している13,14。EAC PDOの10例を対になった腫瘍組織と比較することにより、EAC PDOは原発腫瘍と同様の組織病理学的特徴およびゲノムランドスケープを共有し、腫瘍内の不均一性を保持し、インビトロでの効率的な薬物スクリーニングを促進することが報告されている15。EAC PDOは、EAC腫瘍細胞と患者由来の癌関連線維芽細胞(CAF)との相互作用の研究にも使用され、腫瘍微小環境研究の分野における強力な応用を示している16。残念ながら、EAC PDO の開発と伝達に使用できるプロトコルは限られていました。ここでは、EAC PDOの継代培養と保存について、単一細胞消化の有無にかかわらず、2つの異なる方法を詳細に説明します。EAC PDOとそのアプリケーションのメンテナンスのための標準化された方法は、研究者がEAC PDO研究におけるさまざまな目的に適した方法を選択するのを支援することができます。

Protocol

確立され、よく成長しているPDO培養は、このプロトコルに記載されている継代培養と凍結保存を成功させるための基礎を表しています。ここで、EAC PDOは、Karakasheva T. A. et al17によって記載されたプロトコールを用いて、EAC患者の原発性腫瘍組織から生成された。EAC組織は、BioMaSOTA(ケルン大学倫理委員会、ID:13-091によって承認)の承認の下でバイオバンクから収集された。 <…

Representative Results

このプロトコルは、単一細胞消化の有無にかかわらず、EAC PDOの継代培養および凍結保存を含む手順を提示する。 図1は 、2つの異なる継代培養戦略の代表的な位相差写真を示す。EAC PDOは継代培養に適した密度に達しました(図1、左)。単一細胞消化なしで継代培養すると、同等の密度に達するまでの時間が短縮され、主にコンパ…

Discussion

このプロトコルでは、EAC PDOの2つの異なる継代培養および凍結保存方法、すなわち単一細胞消化の有無にかかわらず記載されている。いくつかの研究では、単一細胞消化15,17によるEAC PDOの継代を推奨しており、これは細胞数制御、均一な密度、およびサイズ追跡を容易にする中空構造を必要とするほとんどの実験にとって有益である。しかしながら…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

この研究はケルン大学ケルン・フォーチュン・プログラム/医学部の支援を受けた。Susanne Neiss、Michaela Heitmann、Anke Wienand-Dorweilerの技術支援に感謝します。寧波ファンは広州エリート奨学金評議会(GESC)から財政的支援を受けました。著者らは、言語編集におけるジョシュア・ドロザリオ博士の協力に感謝する。

Materials

Equipment
-20°C Freezer Bosch Economic
-80°C Freezer Panasonic MDF DU500VH-PE
Automated Cell counter Thermo Fisher AMQAX1000 Countess II
Biological Safety Cabinet Class II Thermo Scientific 51022482 Herasafe KS12
Centrifuge Heraeus 75003060 Megafuge 1.0R
CO2 Incubator Thermo Scientific 50116048 Heracell 150i
Inverted automated fluorescence microscope Olympus IX83
Inverted light microscope Leica DMIL LED Fluo
Pipette 1000 µL Eppendorf 3123000063 Research Plus
Pipette 200 µL Eppendorf 3123000039 Research Plus
Rotating Incubator Scientific Industries, sc. SI-1200 Enviro-genie
Shaker Eppendorf 5355 000.011 Thermomixer Comfort
Vacuum pump Vacuubrand 20727200 BVC control
Waterbath Medingen p2725 W22
Material
15 mL tube Sarstedt 62.554.502 Inc Screw cap tube PP 15 mL
Cryo vial 2 mL Sarstedt 72.379 CryoPure 2.0 mL tube
Low bind tube 1.5 mL Sarstedt 72.706.600 Micro tube 1.5 mL protein LB
Low bind tube 5 mL Eppendorf 0030 108.302 Protein LoBind Tube 5.0 mL
Pipette tip 200 µL Starlab E1011-8000 200 µL Graduated tip, wide orifice
Pipette tip 1000 µL Starlab E1011-9000 1000 µL Graduated tip, wide orifice
Pipette tip 1000 µL Sarstedt 70.3050 Pipette tip 1000 µL
Sterile filter 0.2 µm Sarstedt 83.1826.001 Filtropur 0.2 µm sterile filter
Tissue culture plate Sarstedt 83.3921 12 well-plate
Reagent/Chemical
A83-01 Tocris 2939
Advanced DMEM/F-12 Thermo Fisher Scientific 12634010
Amphotericin B Thermo Fisher Scientific 15290026
B-27 Thermo Fisher Scientific 17504001
Cell Recovery Solution Corning 354253
CHIR-99021 MedChemExpress HY-10182/CS-0181
DNase I grade II, from bovine pancreas Sigma-Aldrich 10104159001
Dulbecco's phosphate-buffered saline (DPBS) Thermo Fisher Scientific 14190094
Extracellular matrix (ECM) gel: Matrigel Growth Factor Reduced (GFR) Basement Membrane Matrix Corning 356231
FGF-10a Peprotech 100-26-100
Freezing medium: Recovery Cell Freezing Medium Thermo Fisher Scientific 12648010
Gastrin Sigma G9020
Gentamicin-25 (25 mg/ 500 µL) PromoCell C-36030
HEPES (1 M) Thermo Fisher Scientific 15630080
L-Glutamine 200 mM (100X) Thermo Fisher Scientific 25030024
N-2 Thermo Fisher Scientific 17502-048
N-Acetylcysteine Sigma A9165
Nicotinamide Sigma N0636-100
Noggin Peprotech 120-10C-50
Penicillin-Streptomycin 10,000 U/ mL (100X) Thermo Fisher Scientific 15140122
Recombinant human epidermal growth factor (EGF) Peprotech AF-100-15
R-Spondin1 conditioned medium from Cultrex R-Spondin Cells Biotechne 3710-001-01
SB202190 MedChemExpress 152121-30-7
Trypsin inhibitor from Glycine max (soybean) Sigma-Aldrich 93620-1G
Trypsin-EDTA (0.25 %), phenol red Thermo Fisher Scientific 25200056
Wnt-3A conditioned medium Wnt-3A expressing cell line was kindly provided by Prof. Hans Clevers' group
Y-27632 Sigma Y0503

References

  1. Sung, H., et al. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: A Cancer Journal for Clinicians. 71 (3), 209-249 (2021).
  2. Coleman, H. G., Xie, S. -. H., Lagergren, J. The epidemiology of esophageal adenocarcinoma. Gastroenterology. 154 (2), 390-405 (2018).
  3. Rumgay, H., et al. International trends in esophageal squamous cell carcinoma and adenocarcinoma incidence. The American Journal of Gastroenterology. 116 (5), 1072-1076 (2021).
  4. Qian, H., et al. Clinical characteristics, prognosis, and nomogram for esophageal cancer based on adenosquamous carcinoma: a seer database analysis. Frontiers in Oncology. 11, 603349 (2021).
  5. Lagergren, J., Smyth, E., Cunningham, D., Lagergren, P. Oesophageal cancer. Lancet. 390 (10110), 2383-2396 (2017).
  6. Rockett, J. C., Larkin, K., Darnton, S. J., Morris, A. G., Matthews, H. R. Five newly established oesophageal carcinoma cell lines: phenotypic and immunological characterization. British Journal of Cancer. 75 (2), 258-263 (1997).
  7. Hashimoto, N. Expression of COX2 and p53 in rat esophageal cancer induced by reflux of duodenal contents. ISRN Gastroenterology. 2012, 1-5 (2012).
  8. Quante, M., et al. Bile acid and inflammation activate gastric cardia stem cells in a mouse model of barrett-like metaplasia. Cancer Cell. 21 (1), 36-51 (2012).
  9. Kapoor, H., Lohani, K. R., Lee, T. H., Agrawal, D. K., Mittal, S. K. Animal models of Barrett’s esophagus and esophageal adenocarcinoma-past, present, and future. Clinical and Translational Science. 8 (6), 841-847 (2015).
  10. Lan, T., Xue, X., Dunmall, L. C., Miao, J., Wang, Y. Patient-derived xenograft: a developing tool for screening biomarkers and potential therapeutic targets for human esophageal cancers. Aging. 13 (8), 12273-12293 (2021).
  11. Liu, D. S. H., et al. APR-246 potently inhibits tumour growth and overcomes chemoresistance in preclinical models of oesophageal adenocarcinoma. Gut. 64 (10), 1506-1516 (2015).
  12. Ebbing, E. A., et al. Esophageal adenocarcinoma cells and xenograft tumors exposed to Erb-b2 receptor tyrosine kinase 2 and 3 inhibitors activate transforming growth factor beta signaling, which induces epithelial to mesenchymal transition. Gastroenterology. 153 (1), 63-76 (2017).
  13. Simian, M., Bissell, M. J. Organoids: A historical perspective of thinking in three dimensions. The Journal of Cell Biology. 216 (1), 31-40 (2017).
  14. Drost, J., Clevers, H. Organoids in cancer research. Nature Reviews Cancer. 18 (7), 407-418 (2018).
  15. Li, X., et al. Organoid cultures recapitulate esophageal adenocarcinoma heterogeneity providing a model for clonality studies and precision therapeutics. Nature Communications. 9, 2983 (2018).
  16. Ebbing, E. A., et al. Stromal-derived interleukin 6 drives epithelial-to-mesenchymal transition and therapy resistance in esophageal adenocarcinoma. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (6), 2237-2242 (2019).
  17. Karakasheva, T. A., et al. Generation and characterization of patient-derived head and neck, oral, and esophageal cancer organoids. Current Protocols in Stem Cell Biology. 53 (1), 109 (2020).
  18. Ordóñez, N. G. Broad-spectrum immunohistochemical epithelial markers: a review. Human Pathology. 44 (7), 1195-1215 (2013).
  19. Maniar, K. P., Umpires, B. Cytokeratin 7 (CK7, K7). Pathology Outlines.com website. , (2021).
  20. Sun, X., Kaufman, P. D. Ki-67: more than a proliferation marker. Chromosoma. 127 (2), 175-186 (2018).
  21. Driehuis, E., Kretzschmar, K., Clevers, H. Establishment of patient-derived cancer organoids for drug-screening applications. Nature Protocols. 15 (10), 3380-3409 (2020).
  22. Sachs, N., et al. Long-term expanding human airway organoids for disease modeling. The EMBO Journal. 38 (4), 100300 (2019).

Play Video

Cite This Article
Fan, N., Raatz, L., Chon, S., Quaas, A., Bruns, C., Zhao, Y. Subculture and Cryopreservation of Esophageal Adenocarcinoma Organoids: Pros and Cons for Single Cell Digestion. J. Vis. Exp. (185), e63281, doi:10.3791/63281 (2022).

View Video