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JoVE Journal Cancer Research
Oncogenic Gene Fusion Detection Using Anchored Multiplex Polymerase Chain Reaction Followed by Next Generation Sequencing

Detecção de fusão gênica oncogênica usando a reação em cadeia de polimerase multiplex ancorada seguida por sequenciamento da próxima geração

DOI:
10.3791/59895-v

•

09:49 min

•

July 05, 2019

•

, ,
1Department of Pathology,University of Colorado – Anschutz Medical Campus

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:49Random Priming and First Strand cDNA Synthesis
  • 01:55Ligation Step 2 and Bead Purification
  • 04:25First PCR and Bead Purification
  • 05:48Library Quantitation and Sequencing
  • 07:41Assay Data Interpretation
  • 08:39Results: Sample Summary and Fusion Calls
  • 09:27Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Este artigo detalha o uso de um kit de preparação de biblioteca com base em reação em cadeia do polymerase multiplex seguido de sequenciamento de próxima geração para avaliar as fusões de genes oncogênicos em amostras de tumores sólidos clínicos. As etapas de análise de dados e de bancada úmida são descritas.

Tags

Gene Fusion DetectionAnchored Multiplex PCRNext-generation SequencingOncogenic Gene FusionsTumor SamplesFormulative FixationDiagnosisPrognosisTreatment SelectionArtifactsRandom PrimingFirst Strand CDNA SynthesisSecond Strand CDNA SynthesisBead PurificationMolecular Barcode Adapter

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