Membran proteinleri izole etmek ve tanımlamak zordur çünkü koklear duyu epitel Proteom analizi nedeniyle küçük boyutu ve zor olabilir. Zar ve çözülebilir proteinler, her ikisi de yüksek çözünürlüklü kütle spektrometrisi ile birlikte birden hazırlama yöntemleri ve ayırma teknikleri birleştirilerek tanımlanabilir.