Протеом анализ кохлеарного сенсорного эпителия может оказаться непростой задачей из-за его небольшого размера и потому мембранные белки трудно выделить и идентифицировать. Оба мембрана и растворимые белки могут быть идентифицированы путем объединения нескольких препаративных методов и методик разделения вместе с масс-спектрометрии высокого разрешения.