Summary

Актина сотрудничества седиментации Пробирной; для анализа связывание белка с F-актин

Published: March 28, 2008
doi:

Summary

Белки связываются с нитчатые актина (Ф-актин), через различные актина обязательные модули. В этом видео мы продемонстрируем процедуры актина совместного осаждения, которая в пробирке анализ обычно используется для анализа белков или конкретных областях, которые связывают F-актина.

Abstract

Актина цитоскелета в клетке представляет собой сеть из нитей актина, который позволяет движение клеток и клеточных процессов, и это создает напряжение и помогает поддерживает сотовые форму. Хотя цитоскелета актина является жесткой структурой, это динамическая структура, которая постоянно ремоделирования. Количество белков могут быть привязаны к актина цитоскелета. Связывания конкретного белка в F-актин часто желаемое для поддержки ячейки биологических наблюдений или для более глубокого понимания динамических процессов за счет реконструкции актина цитоскелета. Актина совместного осаждения анализа является анализ в лабораторных обычно используется для анализа связывания специфических белков или белковых доменов с F-актина. Основные принципы анализа привлекать инкубации белок (полной длины или области) с F-актин, ультрацентрифугирования шаг к гранулы F-актин и анализа белков совместно осаждающихся с F-актина. Актина совместного осаждения анализов могут быть разработаны соответственно для измерения аффинности связывания актина и в анализах конкуренции.

Protocol

1. Подготовка актина Источником актина, используемые в этом анализе был без мышц тромбоцитов человека (β-актин), полученных из цитоскелета Инк аликвоты акции по 10 мг / мл хранятся в морозильной камере -70 º C. Для анализа, актин разбавляют до 0,4 мг / мл в буфере, содержащем 5 мМ Тр…

Discussion

Актина совместного отстаивания просто в пробирке анализа для анализа белков specfic связывания с F-актина. В этом видео мы покажем один пример того, как простой актина совместного осаждения может быть осуществлена. Мы покажем, как готовить F-актин, подготовить белка для проверки и процедуры актина сов…

Acknowledgements

Спасибо доктору Praveen Kumar в Wittman лаборатории в UCSF для фильма актина в НаСаТ клеток.

References

  1. Senetar, M. A., Foster, S. J., McCann, R. O. Intrasteric inhibition mediates the interaction of the I/LWEQ module proteins Talin1, Talin2, Hip1, and Hip12 with actin. Biochemistry. 14, 15418-15428 (2004).
  2. Goldmann, W. H., Hess, D., Isenberg, G. The effect of intact talin and talin tail fragment on actin filament dynamics and structure depends on pH and ionic strength. Eur J Biochem. 260, 439-445 (1999).
  3. Lee, H., Bellin, R. M., Walker, D. L., Patel, B., Powers, P., Liu, H., Garcia-Alvarez, B., de Pereda, J., Liddington, R. C., Volkmann, N., Hanein, D., Critchley, D. R., Robson, R. M. Characterization of an Actin-binding Site within the Talin FERM Domain. J Mol Biol. 22, 771-784 (2004).

Play Video

Cite This Article
Srivastava, J., Barber, D. Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin. J. Vis. Exp. (13), e690, doi:10.3791/690 (2008).

View Video