Белки связываются с нитчатые актина (Ф-актин), через различные актина обязательные модули. В этом видео мы продемонстрируем процедуры актина совместного осаждения, которая в пробирке анализ обычно используется для анализа белков или конкретных областях, которые связывают F-актина.
Abstract
Актина цитоскелета в клетке представляет собой сеть из нитей актина, который позволяет движение клеток и клеточных процессов, и это создает напряжение и помогает поддерживает сотовые форму. Хотя цитоскелета актина является жесткой структурой, это динамическая структура, которая постоянно ремоделирования. Количество белков могут быть привязаны к актина цитоскелета. Связывания конкретного белка в F-актин часто желаемое для поддержки ячейки биологических наблюдений или для более глубокого понимания динамических процессов за счет реконструкции актина цитоскелета. Актина совместного осаждения анализа является анализ в лабораторных обычно используется для анализа связывания специфических белков или белковых доменов с F-актина. Основные принципы анализа привлекать инкубации белок (полной длины или области) с F-актин, ультрацентрифугирования шаг к гранулы F-актин и анализа белков совместно осаждающихся с F-актина. Актина совместного осаждения анализов могут быть разработаны соответственно для измерения аффинности связывания актина и в анализах конкуренции.
Protocol
1. Подготовка актина Источником актина, используемые в этом анализе был без мышц тромбоцитов человека (β-актин), полученных из цитоскелета Инк аликвоты акции по 10 мг / мл хранятся в морозильной камере -70 º C. Для анализа, актин разбавляют до 0,4 мг / мл в буфере, содержащем 5 мМ Тр…
Discussion
Актина совместного отстаивания просто в пробирке анализа для анализа белков specfic связывания с F-актина. В этом видео мы покажем один пример того, как простой актина совместного осаждения может быть осуществлена. Мы покажем, как готовить F-актин, подготовить белка для проверки и процедуры актина сов…
Acknowledgements
Спасибо доктору Praveen Kumar в Wittman лаборатории в UCSF для фильма актина в НаСаТ клеток.
Lee, H., Bellin, R. M., Walker, D. L., Patel, B., Powers, P., Liu, H., Garcia-Alvarez, B., de Pereda, J., Liddington, R. C., Volkmann, N., Hanein, D., Critchley, D. R., Robson, R. M. Characterization of an Actin-binding Site within the Talin FERM Domain.J Mol Biol. 22, 771-784 (2004).
Srivastava, J., Barber, D. Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin. J. Vis. Exp. (13), e690, doi:10.3791/690 (2008).