Summary

굴지 공동 침강 분석, F - 굴지에 바인딩 단백질의 분석

Published: March 28, 2008
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Summary

단백질은 별개의 굴지 구속력이 모듈을 통해 filamentous 굴지 (F – 굴지)에 바인딩합니다. 이 비디오에서 우리는 굴지의 절차를 정기적으로 단백질이나 F – 굴지 바인딩 특정 도메인을 분석하는 데 사용되는 시험 관내 분석이다 공동 침전을 보여줍니다.

Abstract

세포 내에서 굴지의 cytoskeleton는 세포와 세포 프로세스의 움직임을 허용 굴지의 필라멘트의 네트워크이며, 그것은 긴장을 생성하고 세포 모양을 유지하는 데 도움이됩니다. 굴지의 cytoskeleton는 단단한 구조로되어 있지만, 지속적인 리모델링있는 역동적인 구조입니다. 단백질의 숫자는 굴지의 cytoskeleton에 바인딩할 수 있습니다. F – 굴지 특정 단백질의 바인딩은 종종 세포 생물 학적 관찰을 지원하거나 추가로 굴지의 cytoskeleton의 리모델링으로 인해 역동적인 프로세스를 이해하기 원하는 것입니다. 굴지 공동 침강 분석은 정기적으로 특정 단백질이나 F – 굴지와 단백질 도메인의 바인딩을 분석하는 데 사용되는 시험 관내 분석이다. 분석의 기본 원칙은 F – 굴지과 관심의 단백질의 부화 (의 전체 길이 또는 도메인), F – 굴지 공동 sedimenting 단백질의 펠렛 F – 굴지 및 분석 ultracentrifugation 단계를 포함하고 있습니다. 굴지 공동 침강 assays는 굴지 바인딩 동질성 및 경쟁 assays을 측정하기 위하여 적절하게 설계할 수 있습니다.

Protocol

1. 굴지의 준비 이 분석에 사용되는 굴지의 소스는 10 MG / ML은 -70 º C의 냉동고에 보관 Cytoskeleton 주식 회사 주식 aliquots에서 얻은 비 근육 인간의 혈소판 (β – 굴지)되었습니다. 분석은 굴지는 0.4 4 º C. 10 분 대한 20,000g에 centrifuged 5 MM 트리스 산도 8, 0.2 MM CaCl 2, 0.2 MM ATP와 0.5 MM의 DTT를 포함하는 버퍼에 MG / ML로 희석합니다 monomeric 굴지 있습니다 뜨는은 polymerized 될 준비가 ?…

Discussion

굴지 공동 침전은 F – 굴지에 바인딩 specfic 단백질을 분석하는 시험 관내 분석 간단합니다. 이 비디오에서 우리는 간단한 굴지이 공동 침전을 실시 할 수있는 방법 중 하나를 예를 보여줍니다. 우리는 F – 굴지를 준비하는 방법을 보여줍니다, 테스트하는 단백질과 굴지의 절차 공동 침전을 준비합니다. 굴지 공동 침강 assays을 수행하면 포인트의 수를 고려되어야합니다. 예를 들어, 부화에 대한 버퍼 구성 요소가 테…

Acknowledgements

HaCAT 세포에서 굴지의 영화 UCSF에서 위트먼 연구실에서 박사 Praveen 쿠마에 감사합니다.

References

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Cite This Article
Srivastava, J., Barber, D. Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin. J. Vis. Exp. (13), e690, doi:10.3791/690 (2008).

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