El presente protocolo describe el método para analizar la flora intestinal utilizando la secuenciación del gen 16S rRNA basado en Illumina y proporciona un marco para evaluar la eficacia de las decocciones herbales.
Con el fin de explorar preliminarmente los efectos de Desmodium caudatum sobre la gastritis y la flora intestinal en ratas, se estableció un modelo de rata con gastritis crónica utilizando el método clásico de salicilato de sodio. Dieciocho ratas SPF se dividieron en tres grupos: el grupo de control (Grupo C), el grupo modelo (Grupo M) y el grupo de tratamiento (Grupo T). Se tomaron secciones patológicas de la pared gástrica de ratas de cada grupo. Además, las concentraciones de gastrina y malondialdehído en el suero de ratas de cada grupo se determinaron mediante ELISA. Además, se exploraron los efectos de D. caudatum en la flora intestinal de ratas con gastritis a través de una comparación detallada de las comunidades bacterianas intestinales en los tres grupos, empleando la secuenciación del gen 16S rRNA basado en Illumina. Los resultados indicaron que la decocción de D. caudatum podría reducir el contenido de malondialdehído y aumentar el contenido de gastrina. Además, se encontró que la decocción de D. caudatum mejora la diversidad y abundancia de la flora intestinal, ejerciendo un impacto positivo en el tratamiento de la gastritis al regular y restaurar la flora intestinal.
La gastritis crónica (GC), una de las enfermedades clínicas más comunes, se caracteriza por cambios inflamatorios crónicos y persistentes en el epitelio de la mucosa gástrica, que es frecuente y repetidamente atacado por diversos factores patogénicos1. La tasa de incidencia de GC ocupa el primer lugar entre todos los tipos de enfermedades estomacales, representando entre el 40% y el 60% de la tasa de atención ambulatoria en el Servicio de Gastroenterología2. Además, la tasa de incidencia generalmente aumenta con la edad, especialmente en individuos de mediana edad y mayores3. Sin lugar a dudas, la GC reduce significativamente la calidad de vida de las personas, enfatizando la necesidad crítica de descubrir nuevos agentes terapéuticos.
Numerosos estudios han reportado que la aparición y el desarrollo de CG están relacionados con la secreción de hormonas gastrointestinales, como la gastrina (GAS)4,5. El GAS, una hormona peptídica gastrointestinal común en el tracto digestivo, estimula las células para que secreten ácido gástrico al promover la liberación de histamina de los eosinófilos. Además, mejora la nutrición y el riego sanguíneo de la mucosa gástrica, favoreciendo la proliferación de la mucosa gástrica y de las células parietales6. Por lo tanto, la gastrina se puede utilizar como un indicador para evaluar el nivel de desarrollo de CG. Además, los productos de peroxidación lipídica desencadenados por óxidos reactivos pueden activar las células inflamatorias, lo que conduce a la CG. El malondialdehído (MDA), un marcador de peroxidación lipídica, es un indicador comúnmente utilizado para medir el grado de estrés oxidativo. Refleja en cierta medida el nivel de radicales libres en la mucosa gástrica. El nivel de MDA puede indicar el ataque de ácidos grasos insaturados en la mucosa gástrica local causado por radicales libres 7,8.
La microecología intestinal consiste en millones de microorganismos que residen en el intestino del huésped, desempeñando un papel vital en el mantenimiento de la salud del huésped y la regulación de la inmunidad del huésped. Una flora intestinal sana, caracterizada por una alta riqueza, diversidad y una función microbiota estable, actúa como barrera protectora contra la invasión de microorganismos patógenos al participar en el metabolismo. Las alteraciones en la flora intestinal hacen que los individuos sean más susceptibles a las enfermedades gastrointestinales agudas y crónicas 9,10. En los últimos años, la terapia de la microbiota para las enfermedades gastrointestinales ha progresado rápidamente y ha demostrado una eficacia significativa11. En resumen, la consideración de la flora intestinal es crucial para comprender y abordar las enfermedades gastrointestinales.
Como componente indispensable del tesoro oculto de la medicina tradicional china, los materiales medicinales populares tienen una gran importancia para la práctica clínica y la modernización de la medicina nacional. Las raíces y las partes enteras de Desmodium caudatum (Thunb.) DC. se ha utilizado ampliamente para aliviar el malestar estomacal en el área de Beichuan Qiang de la ciudad de Mianyang durante un período prolongado. Algunos artículos indican la base científica para el tratamiento de las enfermedades gastrointestinales con D. caudatum, citando sus efectos como hemostasia, antioxidación y protección gastrointestinal 12,13,14. Sin embargo, debido a la falta de investigación en profundidad, no se ha establecido ningún mecanismo farmacodinámico clínico. Este artículo tiene como objetivo estudiar los efectos de D. caudatum en el tratamiento de la gastritis basada en hormonas gastrointestinales y flora intestinal, proporcionando una base para su aplicación clínica racional.
D. caudatum, una medicina popular comúnmente utilizada por la nacionalidad Qiang12, ha demostrado una eficacia significativa en el tratamiento de enfermedades gastrointestinales. Con el avance de la investigación farmacológica moderna, el desequilibrio de la flora resultante del desequilibrio de la microecología gastrointestinal se identifica como un factor clave en las enfermedades gastrointestinales agudas y crónicas22,23. …
The authors have nothing to disclose.
Este trabajo fue financiado por los proyectos clave de investigación y desarrollo del Departamento de Ciencia y Tecnología de la provincia de Sichuan (2020YFS0539).
Alpha diversity analysis | Mothur 1.30.2 | ||
AxyPrep deoxyribonucleic acid (DNA) gel extraction kit | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
Beta diversity analysis | Qiime 1.9.1 | ||
Cryogenic refrigerator | Forma-86C ULT freezer | ||
Desmodium caudatum | The Traditional Chinese Medicine Hospital of Beichuan Qiang Autonomous County | ||
E.Z.N.A. soil kit | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
Multiskan Spectrum | spectraMax i3 | ||
OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
PCR instrument | TransGen AP221-02 | ||
PCR instrument | ABI GeneAmp 9700 | ||
QuantiFluor-ST double-stranded DNA (dsDNA) system | Promega Corp. | ||
Sequence classification annotation | RDP Classifier 2.11 | ||
Sodium salicylate | Sichuan Xilong Chemical Co., Ltd | 54-21-7 | |
SPF rats | Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd | ||
SPSS 18.0 | IBM |