Le présent protocole décrit la méthode d’analyse de la flore intestinale à l’aide du séquençage du gène de l’ARNr 16S à base d’Illumina et fournit un cadre pour évaluer l’efficacité des décoctions à base de plantes.
Afin d’explorer de manière préliminaire les effets de Desmodium caudatum sur la gastrite et la flore intestinale chez le rat, un modèle de rat de gastrite chronique a été établi en utilisant la méthode classique du salicylate de sodium. Dix-huit rats SPF ont été divisés en trois groupes : le groupe témoin (groupe C), le groupe modèle (groupe M) et le groupe de traitement (groupe T). Des coupes pathologiques de la paroi gastrique ont été prélevées sur des rats de chaque groupe. De plus, les concentrations de gastrine et de malondialdéhyde dans le sérum des rats de chaque groupe ont été déterminées par ELISA. De plus, les effets de D. caudatum sur la flore intestinale des rats atteints de gastrite ont été explorés grâce à une comparaison détaillée des communautés bactériennes intestinales dans les trois groupes, en utilisant le séquençage du gène de l’ARNr 16S basé sur Illumina. Les résultats ont indiqué que la décoction de D. caudatum pouvait réduire la teneur en malondialdéhyde et augmenter la teneur en gastrine. De plus, la décoction de D. caudatum s’est avérée améliorer la diversité et l’abondance de la flore intestinale, exerçant un impact positif sur le traitement de la gastrite en régulant et en restaurant la flore intestinale.
La gastrite chronique (CG), l’une des maladies cliniques les plus courantes, se caractérise par des modifications inflammatoires chroniques et persistantes de l’épithélium de la muqueuse gastrique, qui est fréquemment et de manière répétée attaquée par divers facteurs pathogènes1. Le taux d’incidence de la CG se classe au premier rang parmi tous les types de maladies de l’estomac, représentant 40 % à 60 % du taux de services ambulatoires du département de gastroentérologie2. De plus, le taux d’incidence augmente généralement avec l’âge, en particulier chez les personnes d’âge moyen et plus âgées3. Il ne fait aucun doute que les images de synthèse réduisent considérablement la qualité de vie des gens, soulignant le besoin critique de découvrir de nouveaux agents thérapeutiques.
De nombreuses études ont rapporté que l’apparition et le développement de CG sont liés à la sécrétion d’hormones gastro-intestinales, telles que la gastrine (GAS)4,5. Le SGA, une hormone peptidique gastro-intestinale courante dans le tube digestif, stimule les cellules à sécréter de l’acide gastrique en favorisant la libération d’histamine par les éosinophiles. De plus, il améliore la nutrition et l’apport sanguin de la muqueuse gastrique, favorisant la prolifération de la muqueuse gastrique et des cellules pariétales6. Par conséquent, la gastrine peut être utilisée comme indicateur pour évaluer le niveau de développement du CG. De plus, les produits de peroxydation lipidique déclenchés par des oxydes réactifs peuvent activer les cellules inflammatoires, conduisant à la CG. Le malondialdéhyde (MDA), un marqueur de la peroxydation lipidique, est un indicateur couramment utilisé pour mesurer le degré de stress oxydatif. Il reflète dans une certaine mesure le niveau de radicaux libres dans la muqueuse gastrique. Le taux de MDA peut indiquer l’attaque des acides gras insaturés dans la muqueuse gastrique locale causée par les radicaux libres 7,8.
La microécologie intestinale se compose de millions de micro-organismes résidant dans l’intestin de l’hôte, jouant un rôle essentiel dans le maintien de la santé de l’hôte et la régulation de l’immunité de l’hôte. Une flore intestinale saine, caractérisée par une grande richesse, une grande diversité et une fonction stable du microbiote, agit comme une barrière protectrice contre l’invasion de micro-organismes pathogènes en participant au métabolisme. Les perturbations de la flore intestinale rendent les individus plus sensibles aux maladies gastro-intestinales aiguës et chroniques 9,10. Ces dernières années, la thérapie par microbiote pour les maladies gastro-intestinales a progressé rapidement et a démontré une efficacité significative11. En résumé, la prise en compte de la flore intestinale est cruciale pour comprendre et traiter les maladies gastro-intestinales.
En tant que composant indispensable du trésor de la médecine traditionnelle chinoise, les matériaux médicinaux traditionnels ont une grande importance pour la pratique clinique et la modernisation de la médecine nationale. Les racines et les parties entières de Desmodium caudatum (Thunb.) DC. a été largement utilisé pour soulager les maux d’estomac dans la région de Beichuan Qiang de la ville de Mianyang pendant une période prolongée. Certains articles indiquent la base scientifique du traitement des maladies gastro-intestinales avec D. caudatum, citant ses effets tels que l’hémostase, l’anti-oxydation et la protection gastro-intestinale 12,13,14. Cependant, en raison du manque de recherches approfondies, aucun mécanisme de pharmacodynamique clinique n’a été établi. Cet article vise à étudier les effets de D. caudatum dans le traitement de la gastrite en se basant sur les hormones gastro-intestinales et la flore intestinale, fournissant une base pour son application clinique rationnelle.
D. caudatum, un médicament populaire couramment utilisé par la nationalité Qiang12, a montré une efficacité significative dans le traitement des maladies gastro-intestinales. Avec les progrès de la recherche pharmacologique moderne, le déséquilibre de la flore résultant du déséquilibre de la microécologie gastro-intestinale est identifié comme un facteur clé des maladies gastro-intestinales aiguës et chroniques22,23…
The authors have nothing to disclose.
Ce travail a été financé par les principaux projets de R&D du Département des sciences et de la technologie de la province du Sichuan (2020YFS0539).
Alpha diversity analysis | Mothur 1.30.2 | ||
AxyPrep deoxyribonucleic acid (DNA) gel extraction kit | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
Beta diversity analysis | Qiime 1.9.1 | ||
Cryogenic refrigerator | Forma-86C ULT freezer | ||
Desmodium caudatum | The Traditional Chinese Medicine Hospital of Beichuan Qiang Autonomous County | ||
E.Z.N.A. soil kit | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
Multiskan Spectrum | spectraMax i3 | ||
OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
PCR instrument | TransGen AP221-02 | ||
PCR instrument | ABI GeneAmp 9700 | ||
QuantiFluor-ST double-stranded DNA (dsDNA) system | Promega Corp. | ||
Sequence classification annotation | RDP Classifier 2.11 | ||
Sodium salicylate | Sichuan Xilong Chemical Co., Ltd | 54-21-7 | |
SPF rats | Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd | ||
SPSS 18.0 | IBM |