Мы описываем протокол отбора проб, сохранения и секционного истечения неповрежденных корней и окружающей ризосферной почвы из водно-болотных угодий с использованиемриса (Oryza sativa L.) в качестве модельного вида. После сохранения образец может быть проанализирован с использованием методов элементной визуализации, таких как синхротронная рентгеновская флуоресцентная (XRF) химическая визуализация видообразования.