Hier beschrijven een werkwijze om direct zichtbaar microregional weefselhypoxie in de muis cortex<em> In vivo</em>. Het is gebaseerd op gelijktijdige twee-foton beeldvorming van nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) en de corticale microcirculatie. Deze methode is geschikt voor hoge resolutie analyse van weefsel zuurstof.