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Détection multiplex de bactéries dans les échantillons complexes cliniques et environnementaux à l'aide d'oligonucléotides couplés microsphères fluorescentes
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JoVE Journal Immunology and Infection
Multiplex Detection of Bacteria in Complex Clinical and Environmental Samples using Oligonucleotide-coupled Fluorescent Microspheres
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Détection multiplex de bactéries dans les échantillons complexes cliniques et environnementaux à l'aide d'oligonucléotides couplés microsphères fluorescentes

DOI:
10.3791/3344-v

•

11:09 min

•

October 23, 2011

•

, , , ,
1Saskatoon Research Centre,Agriculture and Agri-Food Canada, 2Department of Veterinary Microbiology,University of Saskatchewan , 3Plant Biotechnology Institute,National Research Council of Canada

Chapters

  • 00:05Title
  • 03:05Coupling Oligonucleotide Probes to Fluorescent Beads
  • 06:37Production of cpn60 Universal Target Amplicon and Generation of Single Strands
  • 09:36Representative Results

Summary

Automatic Translation

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Nous décrivons une méthode multiplex pour la détection des microorganismes dans un échantillon à l'aide d'oligonucléotides couplés billes fluorescentes. Amplicon de tous les organismes au sein d'un échantillon est hybridé à un panel de sondes couplées perles. Un instrument Luminex ou Bio-Plex est utilisé pour interroger chaque perle pour le type de perle et le signal d'hybridation.

Tags

Multiplex DetectionBacteriaClinical SamplesEnvironmental SamplesOligonucleotide-coupled Fluorescent MicrospheresBacterial VaginosisPolymicrobial SyndromeLactobacillusGardnerella VaginalisAtopobium VaginaeNegative Health OutcomesHIV AcquisitionClinical ManagementDiagnosisGram StainsVaginal Swab SmearsSubjective InterpretationsVaginal Microbiota CompositionDeep SequencingMolecular Diagnosis

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