הפרוטוקול הנוכחי מתאר קודים ב-R להערכת יכולות ההבחנה והכיול של מודל סיכון מתחרה, וכן קודים לאימות פנימי וחיצוני שלו.
מודל הסיכון הפרופורציונלי של קוקס מיושם באופן נרחב עבור ניתוחי הישרדות בסביבות קליניות, אך הוא אינו מסוגל להתמודד עם תוצאות הישרדות מרובות. בשונה ממודל הסיכון הפרופורציונלי המסורתי של קוקס, מודלי סיכון מתחרים שוקלים את נוכחותם של אירועים מתחרים ואת שילובם עם נומוגרפיה, מכשיר חישוב גרפי, המהווה כלי שימושי לרופאים לביצוע חיזוי פרוגנוסטי מדויק. במחקר זה אנו מדווחים על שיטה לביסוס נומוגרפיית הסיכון המתחרה, כלומר הערכת יכולות ההבחנה שלה (כלומר, מדד הקונקורדנציה והשטח מתחת לעקומה) והכיול (כלומר, עקומות הכיול), וכן התועלת נטו (כלומר, ניתוח עקומת החלטה). בנוסף, אימות פנימי באמצעות דגימות מחדש של bootstrap של מערך הנתונים המקורי ותיקוף חיצוני באמצעות מערך נתונים חיצוני של נומוגרפיית הסיכון המתחרה הוקמה בוצעו גם כדי להדגים את יכולת האקסטרפולציה שלה. נומוגרפיית הסיכון המתחרה צריכה לשמש כלי שימושי לרופאים לחזות פרוגנוזה תוך התחשבות בסיכונים מתחרים.
בשנים האחרונות זוהו גורמים פרוגנוסטיים מתפתחים עם התפתחות הרפואה המדויקת, ומודלים פרוגנוסטיים המשלבים גורמים מולקולריים וקלינופתולוגיים מושכים תשומת לב גוברת במסגרות קליניות. עם זאת, מודלים לא גרפיים, כגון מודל הסיכון הפרופורציונלי של קוקס, עם תוצאות של ערכי מקדם, קשים לקלינאים להבין1. לשם השוואה, נומוגרפיה היא כלי ויזואליזציה של מודלי רגרסיה (כולל מודל רגרסיה קוקס, מודל סיכון מתחרה וכו ‘), דיאגרמה דו-ממדית המיועדת לחישוב גרפי משוער של פונקציה מתמטית2. הוא מאפשר הערכה של רמות שונות של משתנים במודל קליני וחישוב ציוני סיכון (RS) כדי לחזות פרוגנוזה.
הערכת מודל חיונית בבניית מודלים, ושני מאפיינים מקובלים בדרך כלל להערכה: אפליה וכיול. במודלים קליניים, אפליה מתייחסת ליכולתו של מודל להפריד בין אנשים המפתחים אירועים לבין אלה שלא, כגון חולים שמתו לעומת אלה שנותרו בחיים, ומדד הקונקורדנציה (C-index) או האזור שמתחת לעקומת ההפעלה של המקלט (AUC) משמשים בדרך כלל כדי לאפיין אותו 3,4. כיול הוא תהליך של השוואת ההסתברויות החזויות של מודל עם ההסתברויות בפועל, ועקומות כיול היו בשימוש נרחב כדי לייצג אותו. בנוסף, תיקוף מודל (תיקוף פנימי וחיצוני) הוא שלב חשוב בבניית מודל, ורק מודלים מתוקפים ניתנים לאקסטרפולציה נוספת5.
מודל הסיכון הפרופורציונלי של קוקס הוא מודל רגרסיה המשמש במחקר רפואי לחקר הקשר בין גורמים פרוגנוסטיים למצב הישרדות. עם זאת, מודל הסיכון הפרופורציונלי של קוקס מתייחס רק לשני סטטוסים של תוצאה [Y (0, 1)], בעוד שנבדקי המחקר מתמודדים לעתים קרובות עם יותר משני סטטוסים, וסיכונים מתחרים מתעוררים [Y (0, 1, 2)]1. הישרדות כוללת (OS), המוגדרת כזמן מתאריך המוצא (למשל, טיפול) ועד לתאריך המוות מכל סיבה שהיא, היא נקודת הקצה החשובה ביותר בניתוח הישרדות. עם זאת, מערכת ההפעלה אינה מצליחה להבדיל בין מוות ספציפי לסרטן לבין מוות שאינו ספציפי לסרטן (למשל, אירועים קרדיווסקולריים וסיבות אחרות שאינן קשורות), ובכך מתעלמת מסיכונים מתחרים6. במצבים אלה, מודל הסיכון המתחרה מועדף לחיזוי מצב הישרדות תוך התחשבות בסיכונים מתחרים7. המתודולוגיה של בנייה ותיקוף של מודלי סיכון פרופורציונליים של קוקס מבוססת היטב, בעוד שהיו מעט דיווחים לגבי תיקוף של מודלי סיכון מתחרים.
במחקר הקודם שלנו נקבעה נומוגרפיית סיכון מתחרה ספציפית, שילוב של נומוגרפיה ומודל סיכון מתחרה, ואומדן דירוג סיכון המבוסס על מודל סיכון מתחרה8. מחקר זה נועד להציג שיטות שונות של הערכה ותיקוף של נומוגרפיית הסיכון המתחרה שנקבעה, אשר אמורה לשמש כלי שימושי עבור קלינאים לחזות פרוגנוזה תוך התחשבות בסיכונים מתחרים.
מחקר זה השווה בין נומוגרפיות סיכון מתחרות שנקבעו בשתי שיטות שונות וערך הערכה ותיקוף של הנומוגרפיות שנקבעו. באופן ספציפי, מחקר זה סיפק הדרכה שלב אחר שלב לביסוס הנומוגרפיה על בסיס שיטה ישירה, כמו גם חישוב מדד C והתוויית עקומות הכיול.
חבילת rms בתוכנת R נמצאת בשימוש נרחב לבנ?…
The authors have nothing to disclose.
המחקר נתמך על ידי מענקים מפרויקט תוכנית המדע והטכנולוגיה הרפואית של פרובינציית ג’ג’יאנג (מספרי מענק 2013KYA212), התוכנית הכללית של הקרן למדעי הטבע של מחוז ג’ג’יאנג (מענק מספר Y19H160126), ותוכנית המפתח של לשכת המדע והטכנולוגיה העירונית ג’ינהואה (מענק מספר 2016-3-005, 2018-3-001d ו- 2019-3-013).
R software | None | Not Applicable | Version 3.6.2 or higher |
Computer system | Microsoft | Windows 10 | Windows 10 or higher |