Кишечные микробы, включая внеклеточные бактерии и внутриклеточные патогены, такие как вирус Орсе и микроспоридия (грибы), часто связаны с дикими нематодами Caenorhabditis . В этой статье представлен протокол для обнаружения и количественной оценки микробов, которые колонизируют и / или заражают нематод C. elegans , а также для измерения патогенной нагрузки после контролируемых инфекций в лаборатории.