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Umfassender Workflow der massenspektrometrischen Schrotflintenproteomik von Gewebeproben
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Biology
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JoVE Journal Biology
Comprehensive Workflow of Mass Spectrometry-based Shotgun Proteomics of Tissue Samples
DOI:

14:51 min

November 13, 2021

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Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:42Tissue Lysate Preparation
  • 01:51Quantification and Quality Check of Tissue Lysates
  • 02:33Enzymatic Digestion of Proteins
  • 03:57Desalting of Digested Peptides
  • 05:16Quantification of Desalted Peptides
  • 05:58Labeling of Digested Peptides using iTRAQ Reagents
  • 08:14Liquid Chromatography Set-up
  • 09:25Mass Spectrometry Set-up
  • 12:30Representative Results
  • 13:45Conclusions

Summary

Automatic Translation

Das beschriebene Protokoll bietet eine optimierte quantitative Proteomik-Analyse von Gewebeproben mit zwei Ansätzen: markierungsbasierte und markierungsfreie Quantifizierung. Markierungsbasierte Ansätze haben den Vorteil einer genaueren Quantifizierung von Proteinen, während ein markierungsfreier Ansatz kostengünstiger ist und zur Analyse von Hunderten von Proben einer Kohorte verwendet wird.

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