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Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

Microdissection laser RNA-Sequenciamento para Análise de Expressão Genética Espacial e Temporal-Específica do Tecido em Plantas

DOI:
10.3791/61517-v

•

08:33 min

•

August 05, 2020

•

, , , , ,
1Department of Animal, Plant and Soil Science, AgriBio Building,La Trobe University, 2Australian Research Council Centre of Excellence in Plant Energy Biology,La Trobe University, 3Australian Research Council Research Hub for Medicinal Agriculture, AgriBio Building,La Trobe University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:11Tissue Fixation
  • 01:47Tissue Processing
  • 02:38Paraffin Embedding
  • 03:21Polyethylene Naphthalate (PEN) Membrane Slide Preparation
  • 03:49Sectioning
  • 04:53Laser-Capture Microdissection (LCM)
  • 06:14Results: Representative LCM Sample Acquisition and RNA Quantification
  • 07:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Apresentado aqui é um protocolo para microdisseção de captura a laser (LCM) de tecidos vegetais. LCM é uma técnica microscópica para isolar áreas de tecido de forma livre de contaminação. O procedimento inclui fixação tecidual, incorporação de parafina, secção, LCM e extração de RNA. O RNA é usado na análise temporalmente resolvida do tecido a jusante dos transcriptomes.

Tags

Laser-capture MicrodissectionRNA-sequencingSpatial TranscriptomeTemporal TranscriptomePlant CellsParaffin EmbeddingBarley SeedVacuum InfiltrationDehydrationXyleneParaffin Infiltration

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