Представлен протокол для отслеживания линий и функционального генетического анализа генов-кандидатов на уровне одной клетки с использованием мозаичного анализа с двойными маркерами (MADM). Клональный анализ MADM обеспечивает количественную основу для измерения пролиферативного поведения, клеточного выхода и родовых отношений отдельных прародителей и их клеток дочери.