הפרוטוקול מפתח מודל תלת מימדי (תלת מימדי) של קטע דנדריטי עם קוצים דנדריטיים למידול פלסטיות סינפטית. רשת בנויה יכול לשמש מידול חישובי של סחר קולטן AMPA פלסטיות סינפטית לטווח ארוך באמצעות תוכנית התוכנה בלנדר עם CellBlender ו MCell.