00:36Plant Excavation, Soil Removal, and Bulk Soil Collection
01:46Root and Rhizosphere Collection
02:44Root Surface Sterilization
03:54Processing Rhizosphere Samples
05:02DNA Extraction and Soil Analysis Processing
06:33DNA Extraction in 96-well Format
07:45Rhizosphere Sample Loading
08:47Results: Visualization and Statistical Methods Highlight Differences in Microbial Community Composition and Diversity Between Sample Types and Grass Species
Excavation des racines des plantes sur le terrain, ainsi que traitement d’échantillons dans la rhizosphère, endosphère et le sol sont décrites en détail, y compris les méthodes d’analyse de données et extraction de l’ADN. Cet article est conçu pour permettre aux autres laboratoires d’utiliser ces techniques pour l’étude du sol, endosphère et rhizosphère microbiomes.