الهندسة المعمارية لمجمعات البروتين ضروري لوظيفتها. الجمع بين مختلف التقنيات الجماعية والمطيافيه أثبتت أنها قوية لدراسة تلك الجمعية. توفر البروتوكولات العابرة للربط الكيميائي وأصلي الكتلي، وتبين كيف أن هذه التقنيات التكميلية تساعد على توضيح بنية تجميعات فرعية متعددة البروتين.