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Umfassenden Workflow zur genomweiten Identifizierung und Ausdruck Meta-Analyse von der ATL E3 Ubiquitin Ligase Genfamilie in Grapevine
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Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine
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Umfassenden Workflow zur genomweiten Identifizierung und Ausdruck Meta-Analyse von der ATL E3 Ubiquitin Ligase Genfamilie in Grapevine

DOI:
10.3791/56626-v

•

10:40 min

•

December 22, 2017

•

, , , , , ,
1Dipartimento di Biotecnologie,Università degli Studi di Verona, 2Ecology and Evolution, Research School of Biology,The Australian National University, 3Dipartimento di Agraria, SACEG,Università degli Studi di Sassari

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:04Identifying Putative Gene Family Members, Making Alignments, and Sequence Logos
  • 03:33Phylogenetic Analysis and Nomenclature
  • 06:51Tissue Expression Meta-analysis
  • 08:27Results: Identified ATL Gene Family Members in the Grapevine Genome
  • 09:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Dieser Artikel beschreibt das Verfahren für die Identifizierung und Charakterisierung einer Genfamilie in Grapevine, die zur Familie der Arabidopsis Tóxicos in Levadura (ATL) E3 Ubiquitin Ligases angewendet.

Tags

Genome-wide IdentificationExpression Meta-analysisATL E3 Ubiquitin Ligase Gene FamilyGrapevineGene StructureProtein MotifsChromosomal LocationGene DuplicationsExpression PatternsGene Family CharacterizationProtein BLASTPSI-BLASTFASTABioinformatics Software

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