Здесь мы представляем протокол для выделения эндосимбионтов из белокрылки Bemisia tabaci посредством вскрытия и фильтрации. После амплификации образцы ДНК пригодны для последующего секвенирования и изучения взаимности между эндосимбионтами и белокрылой.