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に薬剤耐性に関連する新規スプライス変異体を検出するために、RNA配列決定を使用して、<em>インビトロ</em>がんモデル
JoVE Journal
Cancer Research
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JoVE Journal Cancer Research
Using RNA-sequencing to Detect Novel Splice Variants Related to Drug Resistance in In Vitro Cancer Models
DOI:

09:58 min

December 09, 2016

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Chapters

  • 00:05Title
  • 01:09Characterization of Drug Resistance Profiles through Cytotoxicity Assays
  • 05:01RNA Isolation and Library Preparation for RNA-sequencing
  • 05:55Validation of the Results by RT-PCR and qRT-PCR Assays
  • 07:21Results: Detection of Differential Splicing Events in Chemotherapy-resistant Cell Lines Compared to Parental Wild-type by Using RNA-sequencing
  • 09:07Conclusion

Summary

Automatic Translation

ここでは、固形腫瘍および血液悪性腫瘍における薬剤耐性に異常なスプライシングの影響を調査することを目的とプロトコルについて説明します。この目標のために、我々は、RNA-seqのを介してin vitroモデルにおける親及び抵抗性のトランスクリプトームプロフィールを分析し、候補遺伝子を検証するための定量RT-PCRベースの方法を確立しました。

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