A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:05Title
- 01:40Constructing Non-essential Query Deletion in an Hfr Cavalli Donor Strain
- 06:42Arraying E. coli F-Recipient Mutants for E. coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screens
- 08:45High-density Strain Mating Procedure to Generate E. coli Double Mutants
- 11:01Results: Representative Analyses of Genetic Interaction (GI) Scores for Determining Pathway-level Functional Relationships
- 13:16Conclusion
Systematische, grootschalige synthetische genetische (gen-gen of epistase) interactie schermen kunnen worden gebruikt om genetische redundantie en route overspraak verkennen. Hier hebben we een high-throughput kwantitatieve synthetische genetische scala screening technologie te beschrijven, genoemd eSGA door ons ontwikkelde voor het ophelderen van epistatisch relaties en het verkennen van genetische interactie netwerken in<em> Escherichia coli</em>.
Tags
Bacterial Functional NetworksPathwaysEscherichia ColiSynthetic Genetic ArraysPhenotypesPhysical InteractionsFunctional InteractionsGene-gene InteractionsGenetic InteractionsGI ScreensEpistatic DependenciesFunctional RelationshipsLarge-scale GI MapsProkaryotesFunctional AnnotationBacterial GenomesQuantitative Bacterial GI Screening MethodsE. Coli Synthetic Genetic Array (eSGA) Screening ProcedureGenome-scale Screening
