Ici, nous décrivons la purification de Legionella pneumophila (L. pneumophila) des vésicules de membrane externe (OMVS) à partir de cultures liquides. Ces vésicules purifiées sont ensuite utilisés pour le traitement des macrophages pour analyser leur potentiel pro-inflammatoire.
Bacteria are able to secrete a variety of molecules via various secretory systems. Besides the secretion of molecules into the extracellular space or directly into another cell, Gram-negative bacteria can also form outer membrane vesicles (OMVs). These membrane vesicles can deliver their cargo over long distances, and the cargo is protected from degradation by proteases and nucleases.
Legionella pneumophila (L. pneumophila) is an intracellular, Gram-negative pathogen that causes a severe form of pneumonia. In humans, it infects alveolar macrophages, where it blocks lysosomal degradation and forms a specialized replication vacuole. Moreover, L. pneumophila produces OMVs under various growth conditions. To understand the role of OMVs in the infection process of human macrophages, we set up a protocol to purify bacterial membrane vesicles from liquid culture. The method is based on differential ultracentrifugation. The enriched OMVs were subsequently analyzed with regard to their protein and lipopolysaccharide (LPS) amount and were then used for the treatment of a human monocytic cell line or murine bone marrow-derived macrophages. The pro-inflammatory responses of those cells were analyzed by enzyme-linked immunosorbent assay. Furthermore, alterations in a subsequent infection were analyzed. To this end, the bacterial replication of L. pneumophila in macrophages was studied by colony-forming unit assays.
Here, we describe a detailed protocol for the purification of L. pneumophila OMVs from liquid culture by ultracentrifugation and for the downstream analysis of their pro-inflammatory potential on macrophages.
Les bactéries peuvent sécréter des facteurs de virulence via différents mécanismes 1. Outre les systèmes sécrétoires bien connus, les bactéries Gram-négatives peuvent échanger des informations et de fournir des facteurs de virulence par des vésicules de la membrane externe (OMVS), qui sont petites, vésicules sphéroïdes 10-300 nm de diamètre et avec une structure de membrane bicouche. Elles sont sécrétées dans une variété de milieux de croissance (culture liquide, culture solide, et les biofilms) et dans toutes les phases de croissance 2, 3. OMV sont un important moyen de transport (par exemple, pour les protéines, les adhésines, les toxines et enzymes, ainsi que pour les LPS, qui se trouve sur la surface OMV) 4. La cargaison intraluminale est protégée de la dégradation protéolytique, il est donc en mesure d'agir sur de longues distances et les vésicules peuvent être trouvées dans les fluides corporels et des organes distants 5, 6,"xref"> 7, 8. Ils ne peuvent pas être reconnus et capturés par les cellules eucaryotes , 9, 10, mais en outre, ils sont capables de faciliter la fixation des bactéries et leur invasion dans des cellules hôtes 4. Legionella pneumophila (L. pneumophila) est une bactérie à Gram négatif qui peut libérer OMV. Dans le poumon humain, il infecte principalement les macrophages alvéolaires, même si son hôte naturel sont l' eau douce amibes 11. Une infection de L. pneumophila peut causer la maladie du légionnaire, une forme grave de pneumonie 12. Il bloque la fusion phagosome-lysosome dans la cellule hôte. Il recrute également des organites d'accueil, dans lequel un créneau de réplication, la vacuole de la Legionella (LCV), est formé 13, 14. dégradation lysosomale est inhibée non seulement par tra de protéines effectricesnslocation via le système de sécrétion de type IV, mais aussi par la libération des 15 OMV.
La purification des OMV à partir de cultures bactériennes est nécessaire pour analyser leur effet sur les cellules receveuses. Des études antérieures ont porté sur la teneur en protéine de L. pneumophila OMV et sur l'influence des vésicules sur les cellules épithéliales alvéolaires 16, mais des études ultérieures avec des greffes de tissus de poumon humain ont démontré que L. pneumophila OMV sont repris par les macrophages alvéolaires 17.
Comme OMVS présents motifs associés à des pathogènes moléculaires (PAMP) et d' autres antigènes bactériens, ils pourraient avoir un impact sur l'infection de cellules eucaryotes et moduler la réponse immunitaire de l' hôte 18. L. pneumophila OMV fusionnent rapidement avec les membranes de la cellule hôte et, en outre, ils activent le TLR2 membraneux 19. Comme il est connu que pneumoph L.ila OMVs stimulent les macrophages et les cellules épithéliales d'une manière pro-inflammatoire 16, 17, nous avons analysé l'impact de l' OMVS sur le processus d'infection dans les macrophages humains et murins.
Ici, nous décrivons un protocole pour la culture de L. pneumophila en culture liquide pour isoler les vésicules de membrane externe sécrétées par ultracentrifugation différentielle et d'évaluer l'impact des vésicules sur les cellules hôtes eucaryotes, que ce soit directement ou à la suite d' une infection.
Les OMV de pathogènes bactériens et l'impact de ces vésicules membranaires sur leurs cellules cibles sont actuellement intensivement étudiés. Par exemple, Clostridium perfringens -derived OMV induisent la sécrétion de cytokines dans les macrophages, les lymphocytes B peuvent être activés par des OMV à partir de Borrelia burgdorferi, et Helicobacter pylori -released vésicules membranaires peuvent agir sur les cellules gastriques epitheliales 21, 22, 23. L. pneumophila, un pathogène intracellulaire qui peut induire une forme grave de pneumonie atypique, libère également OMV qui sont capables d'activer les cellules pulmonaires et les macrophages 16, 19 épithéliales. Ici, nous présentons un protocole détaillé pour l'isolement à petite échelle de L. pneumophila OMV de culture liquide pour étudier le rôle potentiel de l' OMVS dans la pneumonie. Il est essentiel de travailler sous condit stérileions et d'exclure la contamination par d' autres bactéries afin d'obtenir un L. pneumophila pur -derived préparation OMV. L'isolement de l' OMVS comprend une étape de filtration à travers des pores de 0,22 um afin d'éviter la contamination de la pastille OMV obtenue avec L. pneumophila, même si cela réduit le rendement OMV, puisque les plus grands sont perdus par OMV cette étape de filtration.
En outre, nous avons testé la réponse des macrophages humains et murins à ces vésicules isolées et les cellules infectées avec L. pneumophila pour approcher de plus près la situation dans la pneumonie Legionella, où OMV sont libérés à l' intérieur du LCV par des bactéries extracellulaires 15. Les doses employées OMV ont été estimées en fonction de la quantité libre OMV dans une infection des macrophages humains in vitro après 24 h d'incubation (décrits dans la référence 20). Pour la stimulation d'autres cellules réceptrices ou des expériences in vivo,d'autres doses OMV pourraient être nécessaires et doivent être mis en place. L'analyse de l'effet de L. pneumophila OMV représente un progrès le protocole décrit par Jäger et 24 Steinert.
Ici, PMA-différenciés cellules THP-1 servent de modèle pour les macrophages alvéolaires en raison de la disponibilité limitée de matériel humain primaire. L'addition de PMA différencie les monocytaires cellules THP-1 dans des cellules de type macrophage 25. En outre, ils sont une lignée cellulaire modèle bien connu pour L. pneumophila étudie 26. En plus de cette lignée cellulaire monocytaire humaine, les cellules sont utilisées mBMDM. mBMDM sont largement acceptés pour l'étude des effets de L. pneumophila 27, 28, 29. La possibilité d'utiliser KO génétiques pour différents TLR ou d'autres protéines en font un outil précieux pour l'étude des effets OMV. En ordre à réduire la quantité de souris par expérience, mBMDM sont utilisés au lieu des macrophages alvéolaires en raison des limitations des macrophages. expériences clés peuvent nécessiter des macrophages alvéolaires pour validation.
Outre le protocole décrit ici d' une ultracentrifugation pour purifier les OMV, il est possible de réaliser une centrifugation à gradient de densité, qui est inclus dans le protocole par Chutkan et al. 30. Cela pourrait améliorer la pureté de la préparation obtenue OMV et réduire la quantité d'agrégats de co-purifié les protéines, la flagelline, et LPS. La pureté de la préparation d'OMV obtenu peut être analysé par microscopie électronique à transmission ou par analyse de suivi nanoparticule comme une étape supplémentaire dans le contrôle de la qualité. Ceci peut fournir un moyen supplémentaire de quantification au-delà de la procédure de mesure des protéines présentées ici. Éventuellement, la concentration en LPS peut être analysée par un test de lysat Limulus amébocyte. Si le rendement OMV est faible, unl'étape supplémentaire de concentration par des filtres centrifuges pourrait être réalisée, ce qui n'a pas été fait ici. Si le rendement est plus faible que prévu, les OMV ont été rejetées.
Dans le cadre de l'effort continu visant à élucider les mécanismes biologiques et les fonctions derrière OMV, l'influence des différentes conditions de stress sur la production OMV pourrait être testé. La privation des éléments nutritifs, les changements de température d'incubation, ou l' exposition à des agents nocifs pourrait avoir un impact sur la sécrétion 31 OMV. Conditions de stress possibles sont discutées dans le protocole par Klimentova et Stulik 32. En outre, les mutants hyper- ou hypovesiculating L. pneumophila pourraient être générés. Les différentes préparations d' OMV pourraient ensuite être analysés dans des expériences d'infection avec des macrophages, des explants de tissus de poumon humain (décrit dans la référence 17), ou même dans des modèles in vivo. Outre le rôle de l'OMVS dans la signalisation immunitaire innée, leur influence dans la communication bactériennepeuvent être traités expérimentalement. En outre, l'impact des différentes cascades de signalisation immunitaire innée pourrait être analysé par l'utilisation de cellules knockout murins ou la génération de CRISPR KO / cas9 dans des lignées cellulaires humaines. Cette recherche fondamentale en OMVS aider à l'élaboration de nouvelles stratégies de vaccination, qui existent déjà pour la méningite B transmise par Neisseria meningitidis 33.
A partir du protocole sur OMV isolement et la caractérisation, on peut l'appliquer à d'autres bactéries gram-négatives et d'autres cellules hôtes; il doit seulement être adaptée à la croissance des bactéries dans une culture liquide. Le protocole publié par Chutkan et al. fournit des informations détaillées sur la production d'OMV à partir d' Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa 30. La culture ne doit pas atteindre la phase stationnaire tardive afin d'éviter l'augmentation des bactéries lysées et les protéines contaminantes et membranes. En outre, la dose OMV utilisée pour la stimulation des cellules hôtes doit être déterminé en fonction du montant de l' OMVS présente au cours des infections in vivo, tout en assurant un taux de cytotoxicité faible. De cette façon, le rôle pathologique de l'OMVS, leur impact sur la communication inter-espèces, et les interactions hôte-pathogène pourrait être examinée.
Pour étudier davantage le rôle de L. pneumophila OMVS pneumonie, des préparations normalisées OMV avec des rendements et des expériences d'infection comparables suffisantes sont nécessaires. Ce protocole contribuera à normaliser les procédures d'isolement et d'étendre les études OMV à d'autres bactéries Gram-négatives et à d'autres cellules hôtes. En outre, la recherche bénéficiera de la fiche détaillée de la connaissance in vitro, qui peut être utilisé pour étendre les expériences aux paramètres in vivo. À l'avenir, ce protocole pourrait être étendu à l'isolement de l'OMVS de matériel biologique primaire, tels que le sérum ou le lav bronchoalvéolairefluide d'âge, pour mieux comprendre dans la composition de l'OMVS libéré dans des conditions physiologiques. Cela aidera à déterminer les paramètres clés de la composition OMV et de comprendre les propriétés de l' OMVS -generated in vitro.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Prof. Dr. Markus Schnare pour nous offrir un TLR2 – / – et TLR2 / 4 – / – souris et Prof. Dr. Carsten Kirschning pour TRIF / MyD88 – / – souris. Certaines parties de ce travail a été financé par Bundesministerium für Bildung und Forschung (e: miRSys bio – FKZ 0316175B, e: Med CAPSYS – FKZ 01X1304E; http://www.bmbf.de/), Deutsche Forschungsgemeinschaft (SFB / TR-84; http://www.sfb-tr84.de/) et Hessisches Ministerium für Wissenschaft und Kunst (LOEWE RNomique médicaux – FKZ 519/03 / 00.001- (0003); http://www.proloewe.de/medicalrnomics), tous BS.
10 cm petridish | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 82.1473 | |
70 Ti rotor | Beckman Coulter Incorporation (California, USA) | 337922 | |
ACES | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 9138.2 | |
activated charcoal | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | X865.2 | |
agar-agar, Kobe I | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 5210.2 | |
Columbia agar with 5 % sheep blood | Becton Dickinson GmbH (Heidelberg, Germany) | 254005 | |
cuvettes | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 67.742 | |
ELISA (human) | BD OptEIA™; Becton Dickinson GmbH (Heidelberg, Germany) | IL-8: 555244 IL-6: 550799 | |
ELISA (murine) | DuoSet, R&D (Minneapolis, USA) | CXCL1: DY453-05 | |
Fe(NO3)3x9H2O | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 5632.1 | |
Fetal calf serum (FCS) | Life Technologies GmbH (Darmstadt, Germany) | 10270-106 | |
Heracell 240i CO2 incubator | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 40830469 | |
Heraeus Multifuge X3R | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 75004515 | |
Inoculation loop | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 86.1567.010 | |
KOH | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 6751.1 | |
L. pneumophila Corby | — | — | kindly provided by Prof Dr Antje Flieger (RKI, Berlin, Germany) |
L. pneumophila Corby ΔflaA | — | — | kindly provided by Prof Dr Klaus Heuner (RKI, Berlin, Germany) |
L-cystein | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | ||
mBMDM | — | — | kindly provided by Prof Dr Markus Schnare (Philipps Univeristy Marburg, Marburg, Germany) and Prof Dr Carsten Kirschning (University Duisburg Essen, Essen, Germany) |
PBS | Biochrom GmbH (Berlin, Germany) | L 1825 | |
phorbol 12-myristate 13-acetate | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Taufkirchen, Germany) | P8139-1MG | |
rotating shaker (MaxQ 6000) | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | SHKE6000 | |
RPMI 1640 high glucose | Life Technologies GmbH (Darmstadt, Germany) | 11875-093 | |
saponin | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 9622.1 | |
Ultrospec 10 | Biochrom Ltd (Cambridge, England) | 80-2116-30 | |
sterile filter (pore size: 0.22 µm) | Corning Incorporated (new York, USA) | 431096 | |
THP-1 | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Taufkirchen, Germany) | 88081201-1VL | |
Sorvall Discovery 100 SE | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | ||
yeast extract | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 2363.2 | |
Pierce BCA protein assay kit | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 23225 |