פיתחנו חצי אוטומטיות Heartbeat אופטי ניתוח בשיטה (סוהא) לניתוח הקלטות מהירות גבוהה אופטי מ<em> תסיסנית</em>, דג הזברה ולבבות עובריים בעכבר. אנו להדגים את היישום של המתודולוגיה שלנו לניתוח של תפקוד הלב זבוב הפירות ולבבות עכבר עובריים.
Abstract
פיתחנו שיטה לניתוח הקלטות מהירות גבוהה אופטי מ<em> תסיסנית</em>, דג הזברה ולבבות עובריים בעכבר (פינק, et. Al. 2009). ניתוח חצי אוטומטי שלנו Heartbeat אופטי (סוהא) משתמשת התנועה רומן איתור אלגוריתם זה מסוגל לזהות תנועות הלב הקשורים כויץ בודדים ואירועים הרפיה. התוכנית מספקת מגוון רחב של פיזיולוגית readouts הרלוונטיים כולל סיסטולי ודיאסטולי במרווחים, קצב הלב, כמו גם צעדים איכותי וכמותי של arrhythmicity דופק. התוכנית גם מחשבת קוטר מדידות לב במהלך תרויח וגם התכווצות שממנו קיצור השבר ושינויים אזור השבר מחושבים. פלט מסופק כקובץ דיגיטלי תואם תוכניות גיליון אלקטרוני ביותר. המדידות נעשות עבור כל פעימת לב ברשומה הגדלת כוח סטטיסטיות של התפוקה. אנו מדגימים כל הצעדים שבהם קלט משתמש נדרש להראות את היישום של המתודולוגיה שלנו כדי ניתוח של תפקוד הלב בכל שלושת הדגמים לב ממושמע מבחינה גנטית.
Protocol
לחץ כאן כדי להציג סקירה של ההליך חצי אוטומטיות ניתוח (סוהא) דופק. חצי אוטומטיות דופק אופטי ניתוח 1. Preprocess – צעד זה מ?…
Discussion
המודל תסיסנית הוכיחה להיות כלי רב עוצמה גנטי, שבו נעשה שימוש כדי לענות על מגוון שאלות מדעיות החל ההתפתחות העוברית על למידה וזיכרון. לאחרונה אורגניזם מודל זה צדדי נעשה שימוש כדי לחקור את הגנטיקה של תפקוד הלב. מספר נסיונות לכמת הפיזיולוגיה הלב המבוגר תסיסנית הסתמכו על …
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
ק.א. ו-AC נתמכים על ידי מענק ו מלגה מאיגוד הלב האמריקני. SIB ו RB הם נתמך על ידי מענקים NIH.
Materials
Material Name
Type
Company
Catalogue Number
Comment
MatLab software
Math Works, Inc
Required environment for the analysis software.
EM-CCD digital camera
Hamamatsu Corp.
9100 or 9300
Other high speed digital cameras will also work.
HC image data capture software
Hamamatsu Corp.
Other image capture software that produces movies in avi format will also work.
Light Microscope with 10x objective
Leica
A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution
Ocorr, K., Fink, M., Cammarato, A., Bernstein, S. I., Bodmer, R. Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts. J. Vis. Exp. (31), e1435, doi:10.3791/1435 (2009).